RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC8Q8TAM2 541 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PTPRN2Q92932 1015 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 HOOK2Q96ED9 719 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CDH19Q9H159 772 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ADCY9O60503 1353 aa7.31□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 GABRDO14764 452 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 BRINP1O60477 761 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 BPIP17213 487 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ITIH2P19823 946 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 GRIK1P39086 918 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF445P59923 1031 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 HTRA3P83110 453 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 TMPRSS15P98073 1019 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP4F3Q08477 520 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf159Q96HA4 380 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CHST12Q9NRB3 414 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.3□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 SBF2Q86WG5 1849 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCC5O15440 1437 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CAND2O75155 1236 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CEACAM5P06731 702 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ITGA4P13612 1032 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CFAP100Q494V2 611 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ARTNQ5T4W7 220 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 DTX1Q86Y01 620 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CNTD1Q8N815 330 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.29□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 TNKSO95271 1327 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CRTAMO95727 393 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP4K2Q12851 820 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP2R5DQ14738 602 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 CHMP4CQ96CF2 233 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC1Q99614 292 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 IFT22Q9H7X7 185 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.27□□□□□ -1.24
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A087WZG4 1122 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 M0R2C6 588 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNJ6P48051 423 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 PASD1Q8IV76 773 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 USP7Q93009 1102 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 Q96M66 194 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 VAMP4O75379 141 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 CBX7O95931 251 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SCG5P05408 212 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXC12P31275 282 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 CD96P40200 585 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADBP1-201ENST00000478954 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.26□□□□□ -1.25
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