RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, human

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KIF2C	Q99661	725 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612		H3BRB1	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TREH	O43280	583 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FIBP	O43427	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NBN	O60934	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	STAM2	O75886	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ATG7	O95352	703 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CCNE2	O96020	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FGB	P02675	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CYP3A4	P08684	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CKB	P12277	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MYOG	P15173	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ATP4A	P20648	1035 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SREBF1	P36956	1147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SP4	Q02446	784 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RBL2	Q08999	1139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	STK3	Q13188	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NEDD9	Q14511	834 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PTGIS	Q16647	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ME3	Q16798	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GPR153	Q6NV75	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	OXER1	Q8TDS5	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CUL5	Q93034	780 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GJA10	Q969M2	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LENG9	Q96B70	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PITPNM1	O00562	1244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PFKFB2	O60825	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LGR5	O75473	907 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CXCL10	P02778	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CIITA	P33076	1130 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms