RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	TM4SF4	P48230	202 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	NLRP12	P59046	1061 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	KRT76	Q01546	638 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	IRF5	Q13568	498 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	EPHA7	Q15375	998 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218		Q3C1V9	767 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	MLKL	Q8NB16	471 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	MMP19	Q99542	508 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	PTPN18	Q99952	460 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	POTEM	A6NI47	508 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	ASB14	A6NK59	587 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	PPP1R2	P41236	205 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	JAK3	P52333	1124 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	DPYD	Q12882	1025 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	GRB10	Q13322	594 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	KCNB1	Q14721	858 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	SV2B	Q7L1I2	683 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	IFNL1	Q8IU54	200 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	IL31RA	Q8NI17	732 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	PANK2	Q9BZ23	570 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	PP2D1	A8MPX8	630 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	LYPLA2	O95372	231 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	AR	P10275	920 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	CDC25A	P30304	524 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	NOG	Q13253	232 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	PNOC	Q13519	176 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	RAD54L	Q92698	747 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	PNMA5	Q96PV4	448 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	KCND2	Q9NZV8	630 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	DNM3	Q9UQ16	869 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	TLR2	O60603	784 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF165	P49910	485 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	APLP1	P51693	650 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	UBXN2A	P68543	259 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	PDE4D	Q08499	809 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	MORC3	Q14149	939 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	NACC1	Q96RE7	527 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	MTR	Q99707	1265 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	CREBZF	Q9NS37	354 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RPS18-231	ENST00000472218	RASSF10	A6NK89	507 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	EYA4	O95677	639 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	KCNA2	P16389	499 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	AFM	P43652	599 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	CNTN2	Q02246	1040 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	GRB14	Q14449	540 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	NEDD9	Q14511	834 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48

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