RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 SLFN13Q68D06 897 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 PSMB7Q99436 277 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 NPR1P16066 1061 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 USP11P51784 963 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CREG2Q8IUH2 290 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 COG1Q8WTW3 980 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 RASSF7Q02833 373 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 MED24O75448 989 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CYP11B2P19099 503 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 SNAP25P60880 206 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CEP63Q96MT8 703 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CEP72Q9P209 647 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 POTEFA5A3E0 1075 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 POTEIP0CG38 1075 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CXCR5P32302 372 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 POTEGQ6S5H5 508 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 FAM71BQ8TC56 605 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 DCAF4Q8WV16 495 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.61■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 PRR16Q569H4 304 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 HGSNATQ68CP4 663 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 HINFPQ9BQA5 517 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 NOL4O94818 638 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 GNA14O95837 355 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 ALDH1B1P30837 517 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 APBA1Q02410 837 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 MED4Q9NPJ6 270 aa22.6■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 MEIS2O14770 477 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 BUB1O43683 1085 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 EPS15P42566 896 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP4P98171 946 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 MKL1Q969V6 931 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 NYAP2Q9P242 653 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 NCK2O43639 380 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 MYBL2P10244 700 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 ICA1Q05084 483 aa22.58■■□□□ 1.21
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IMP4-208ENST00000460766 USH1GQ495M9 461 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CCDC181Q5TID7 509 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 PRLRP16471 622 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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IMP4-208ENST00000460766 SLC12A3P55017 1021 aa22.58■■□□□ 1.21
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IMP4-208ENST00000460766 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 NOX5Q96PH1 765 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-208ENST00000460766 MEIS1O00470 390 aa22.57■■□□□ 1.2
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