RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa30.15■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP26Q9BXU7 913 aa30.15■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf102A2RUQ5 167 aa30.14■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF20Q5VTR2 975 aa30.14■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAF7Q6Q0C0 670 aa30.14■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERINC5Q86VE9 423 aa30.14■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSTPIP2Q9H939 334 aa30.14■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CERS4Q9HA82 394 aa30.14■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THEGQ9P2T0 379 aa30.14■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLL1O43897 1013 aa30.13■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRX1Q86UT6 975 aa30.13■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SKAP1Q86WV1 359 aa30.13■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC82Q8N4S0 544 aa30.13■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FANCBQ8NB91 859 aa30.13■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V0A1Q93050 837 aa30.13■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR20Q99678 358 aa30.13■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa30.12■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa30.12■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa30.12■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAP1Q03518 808 aa30.12■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMTC3Q6ZXV5 915 aa30.12■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGMS1Q86VZ5 419 aa30.12■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SENP7Q9BQF6 1050 aa30.12■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBED2Q9BTP6 218 aa30.12■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOCK5Q9H7D0 1870 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFXAPO00287 272 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCAB14O75071 495 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THPOP40225 353 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB103AP81534 67 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IKBKEQ14164 716 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBTPS1Q14703 1052 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCTN1Q2MV58 587 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MICU3Q86XE3 530 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MICALL1Q8N3F8 863 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRSQ13332 1948 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC28Q96AY4 2481 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF15O94989 841 aa30.1■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXC8P31273 242 aa30.1■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARNTL2Q8WYA1 636 aa30.1■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNPEPQ9H4A4 650 aa30.1■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMSYQ7Z589 1322 aa30.1■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSPH10B2B2RC85 870 aa30.09■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LGR5O75473 907 aa30.09■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSPH10BP0C881 870 aa30.09■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SP4Q02446 784 aa30.09■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEK1Q96PY6 1258 aa30.09■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TREHO43280 583 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNAT1P11488 350 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2SQ16763 222 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM50Q86XT4 487 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPRASP2Q96D09 838 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDHR1Q96JP9 859 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TELO2Q9Y4R8 837 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPOPA6NHQ4 379 aa30.07■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPDYE3A6NKU9 549 aa30.07■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOA5Q6Q788 366 aa30.07■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SETD4Q9NVD3 440 aa30.07■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTCH2Q9Y6C9 303 aa30.07■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCHNA4D1U4 455 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASB2Q96Q27 587 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJB5O95377 273 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD9AQ99638 391 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHA6Q9UN73 950 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP9AO75110 1047 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAND2O75155 1236 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC45O75419 566 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNA2P16389 499 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGB5P18084 799 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DBF4BQ8NFT6 615 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCEANC2Q96MN5 208 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REV3LO60673 3130 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTMR1Q13613 665 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSGA10IPQ3SY00 556 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRED2Q7Z698 418 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EHMT1Q9H9B1 1298 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB43O43298 467 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTSHP09668 335 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP4P98171 946 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT32Q14532 448 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms