RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441587.2

ALMS1-IT1-201, ALMS1 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ALMS1-IT1, Length 2,107 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FBXO10Q9UK96 956 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SOX13Q9UN79 622 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.66□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FAM25EA8MYX2 175 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 M0R2C6 588 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CCP110O43303 1012 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CCDC172P0C7W6 258 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RAC2P15153 192 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SERPINB3P29508 390 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 UBASH3AP57075 661 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IL2P60568 153 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 UBXN2AP68543 259 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MECOMQ03112 1051 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GRM3Q14832 879 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PTPRN2Q92932 1015 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HVCN1Q96D96 273 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LRGUKQ96M69 825 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TIGD1Q96MW7 591 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SLC6A18Q96N87 628 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LGR4Q9BXB1 951 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 STRN4Q9NRL3 753 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ITM2BQ9Y287 266 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KIF3AQ9Y496 699 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ABCC1P33527 1531 aa6.65□□□□□ -1.34
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TRIM64BA6NI03 449 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PTPRAP18433 802 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 STT3AP46977 705 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CBX1P83916 185 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 COX10Q12887 443 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PPP2R5CQ13362 524 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IKBKEQ14164 716 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GJA10Q969M2 543 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FGD4Q96M96 766 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IGFLR1Q9H665 355 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MKS1Q9NXB0 559 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IL16Q14005 1332 aa6.65□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KLHL33A6NCF5 533 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MT-CO1P00395 513 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PRPHP41219 470 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ROR1Q01973 937 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TNP2Q05952 138 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FAPQ12884 760 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GRM1Q13255 1194 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 BVESQ8NE79 360 aa6.64□□□□□ -1.35
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SNX21Q969T3 373 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms