RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 CXCL10P02778 98 aa29.02■■■□□ 2.24
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ANKRD28-203ENST00000439830 CYFIP1Q7L576 1253 aa29.02■■■□□ 2.24
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ANKRD28-203ENST00000439830 WNT8BQ93098 351 aa29.02■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 NEK1Q96PY6 1258 aa29.02■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 USP26Q9BXU7 913 aa29.02■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
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ANKRD28-203ENST00000439830 NLRX1Q86UT6 975 aa29.01■■■□□ 2.23
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ANKRD28-203ENST00000439830 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.99■■■□□ 2.23
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ANKRD28-203ENST00000439830 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
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ANKRD28-203ENST00000439830 TLL1O43897 1013 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD28-203ENST00000439830 EFCAB14O75071 495 aa28.97■■■□□ 2.23
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ANKRD28-203ENST00000439830 MBTPS1Q14703 1052 aa28.97■■■□□ 2.23
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ANKRD28-203ENST00000439830 UBE2SQ16763 222 aa28.97■■■□□ 2.23
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ANKRD28-203ENST00000439830 IKBKEQ14164 716 aa28.95■■■□□ 2.22
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ANKRD28-203ENST00000439830 ZBTB43O43298 467 aa28.94■■■□□ 2.22
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ANKRD28-203ENST00000439830 GNAT1P11488 350 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 RTN1Q16799 776 aa28.94■■■□□ 2.22
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ANKRD28-203ENST00000439830 ITGB5P18084 799 aa28.93■■■□□ 2.22
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ANKRD28-203ENST00000439830 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 MTMR1Q13613 665 aa28.92■■■□□ 2.22
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ANKRD28-203ENST00000439830 MICALL1Q8N3F8 863 aa28.92■■■□□ 2.22
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ANKRD28-203ENST00000439830 SETD4Q9NVD3 440 aa28.92■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.92■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 ATP9AO75110 1047 aa28.91■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 GJB5O95377 273 aa28.91■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 NAPAP54920 295 aa28.91■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 EPOPA6NHQ4 379 aa28.9■■■□□ 2.22
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