RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 STXBP2Q15833 593 aa30.09■■■□□ 2.41
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MSX1-201ENST00000382723 KIAA1024Q9UPX6 916 aa30.09■■■□□ 2.41
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MSX1-201ENST00000382723 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
MSX1-201ENST00000382723 KCNK18Q7Z418 384 aa30.08■■■□□ 2.41
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MSX1-201ENST00000382723 STK17AQ9UEE5 414 aa30.08■■■□□ 2.41
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MSX1-201ENST00000382723 LCTP09848 1927 aa30.08■■■□□ 2.41
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MSX1-201ENST00000382723 E9PMD0 336 aa30.04■■■□□ 2.4
MSX1-201ENST00000382723 EDNRBP24530 442 aa30.04■■■□□ 2.4
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MSX1-201ENST00000382723 DYDC2Q96IM9 177 aa30.04■■■□□ 2.4
MSX1-201ENST00000382723 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
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MSX1-201ENST00000382723 CBX8Q9HC52 389 aa30.03■■■□□ 2.4
MSX1-201ENST00000382723 B4DLN1 442 aa30.02■■■□□ 2.4
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MSX1-201ENST00000382723 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
MSX1-201ENST00000382723 CDHR1Q96JP9 859 aa30.02■■■□□ 2.4
MSX1-201ENST00000382723 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
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MSX1-201ENST00000382723 MYL1P05976 194 aa30■■■□□ 2.39
MSX1-201ENST00000382723 KCNA2P16389 499 aa30■■■□□ 2.39
MSX1-201ENST00000382723 PSMC6P62333 389 aa30■■■□□ 2.39
MSX1-201ENST00000382723 TRIM9Q9C026 710 aa30■■■□□ 2.39
MSX1-201ENST00000382723 TUFT1Q9NNX1 390 aa30■■■□□ 2.39
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