RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 MXRA8Q9BRK3 442 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 RGL1Q9NZL6 768 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 DNM3Q9UQ16 869 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 CHMP2AO43633 222 aa19.93■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 UTRNP46939 3433 aa19.93■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.781e-323■■□□□ 13.6
ACTB-201ENST00000331789 C9orf131Q5VYM1 1079 aa19.93■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 CENPPQ6IPU0 288 aa19.93■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 C12orf42Q96LP6 360 aa19.93■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF577Q9BSK1 485 aa19.93■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 GAS7O60861 476 aa19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 ITGB5P18084 799 aa19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 PPP2R5CQ13362 524 aa19.92■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 CEP135Q66GS9 1140 aa19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D7Q9P0N9 293 aa19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 RIPK3Q9Y572 518 aa19.92■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 DYDC2Q96IM9 177 aa19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 HSD17B14Q9BPX1 270 aa19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 NRDCO43847 1150 aa19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 KRT18P05783 430 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 FDX1P10109 184 aa19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 SETQ01105 290 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 CCDC65Q8IXS2 484 aa19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 CCDC112Q8NEF3 446 aa19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 REPS2Q8NFH8 660 aa19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 UNC45AQ9H3U1 944 aa19.91■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa19.91■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 SLITRK3O94933 977 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 FAM26FQ5R3K3 315 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa19.9■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K9P80192 1104 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 COG2Q14746 738 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 RNF207Q6ZRF8 634 aa19.9■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 RNF146Q9NTX7 359 aa19.9■□□□□ 0.78
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
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ACTB-201ENST00000331789 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
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ACTB-201ENST00000331789 PCNX4Q63HM2 1172 aa19.89■□□□□ 0.77
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ACTB-201ENST00000331789 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 TEKT3Q9BXF9 490 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 BHMT2Q9H2M3 363 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 ZHX3Q9H4I2 956 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 TUFT1Q9NNX1 390 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PNMA2Q9UL42 364 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa19.89■□□□□ 0.77
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ACTB-201ENST00000331789 FRMD3A2A2Y4 597 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 EYA4O95677 639 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 KRT26Q7Z3Y9 468 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 SULF1Q8IWU6 871 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PIGOQ8TEQ8 1089 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa19.88■□□□□ 0.77
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