RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.38■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 FBXL16Q8N461 479 aa20.38■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.37■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.37■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.37■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.37■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 SORBS3O60504 671 aa20.37■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 HSPA4P34932 840 aa20.37■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.37■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.37■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.36■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.36■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.36■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.36■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.35■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.35■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.35■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 JADE2Q9NQC1 790 aa20.35■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 SCN5AQ14524 2016 aa20.34■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 EMSYQ7Z589 1322 aa20.34■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.34■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 EFCAB14O75071 495 aa20.34■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 CAND2O75155 1236 aa20.34■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 REC8O95072 547 aa20.34■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.34■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.34■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.34■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.34■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 BARHL2Q9NY43 387 aa20.34■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 TET1Q8NFU7 2136 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 ATP9AO75110 1047 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 MYOGP15173 224 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 NAPAP54920 295 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 FGD1P98174 961 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 VCANP13611 3396 aa20.32■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 MYO9BQ13459 2157 aa20.32■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 STXBP3O00186 592 aa20.32■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 CDC27P30260 824 aa20.32■□□□□ 0.84
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HDDC3-201ENST00000330334 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.31■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 TREHO43280 583 aa20.31■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 RSPH10BP0C881 870 aa20.31■□□□□ 0.84
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HDDC3-201ENST00000330334 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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HDDC3-201ENST00000330334 Q6ZUG5 572 aa20.31■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.31■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.31■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 NID2Q14112 1375 aa20.31■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 TRANK1O15050 2925 aa20.3■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.3■□□□□ 0.84
HDDC3-201ENST00000330334 SMCO2A6NFE2 343 aa20.3■□□□□ 0.84
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