RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.82■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 CDH23Q9H251 3354 aa20.81■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 PIK3CDO00329 1044 aa20.81■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 MMP3P08254 477 aa20.81■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 CCND2P30279 289 aa20.81■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 NLRP5P59047 1200 aa20.81■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.81■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.81■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 SMCO2A6NFE2 343 aa20.8■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 CYP2C18P33260 490 aa20.8■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.8■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.8■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 GNA11P29992 359 aa20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 SP2Q02086 613 aa20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 HIPK3Q9H422 1215 aa20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 C6orf50Q9HD87 102 aa20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.79■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 TGFB3P10600 412 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 CSF2RAP15509 400 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 KRT2P35908 639 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 LAMC2Q13753 1193 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 CUL5Q93034 780 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 M0R2N6 131 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 F13A1P00488 732 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 ADCY7P51828 1080 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 RESTQ13127 1097 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 Q7L0L9 218 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 BLIDQ8IZY5 108 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 TMEM199Q8N511 208 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 PPTC7Q8NI37 304 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 BICD2Q8TD16 824 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 KAT2BQ92831 832 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.78■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 BTBD18B2RXH4 712 aa20.77■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 GGPS1O95749 300 aa20.77■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 DGKDQ16760 1214 aa20.77■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.77■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 MCTP1Q6DN14 999 aa20.77■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 OXER1Q8TDS5 423 aa20.77■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 KIF28PB7ZC32 967 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 ADAMTS3O15072 1205 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 SORBS3O60504 671 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 STAM2O75886 525 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 CYP2C9P11712 490 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 SEMA3FQ13275 785 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 TMEM240Q5SV17 173 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 FERMT3Q86UX7 667 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 DEFB123Q8N688 67 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 TNFRSF25Q93038 417 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.76■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 ICAM3P32942 547 aa20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 NR5A1Q13285 461 aa20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 UBE2SQ16763 222 aa20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 GNPTABQ3T906 1256 aa20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 BRAPQ7Z569 592 aa20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.75■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.74■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 F2P00734 622 aa20.74■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 ACRP10323 421 aa20.74■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 CCL23P55773 120 aa20.74■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 CHMP4BP1P59074 171 aa20.74■□□□□ 0.91
PTX4-201ENST00000293922 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms