RNA–Protein interactions for RNA: YMR078C

CTF18, Transcript of Subunit of a complex with Ctf8p, yeast

Gene CTF18, Length 2,226 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTF18	YMR078C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	VPS54	Q12071	889 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	CTF3	Q12748	733 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	SCEI	P03882	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	BRF1	P29056	596 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	REC114	P32841	428 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	RPH1	P39956	796 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
CTF18	YMR078C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	AVT4	P50944	713 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	COS10	P52924	374 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	GYL1	Q04322	720 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	DCS1	Q06151	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	SPO7	P18410	259 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	ELP2	P42935	788 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YIP1	P53039	248 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YGR111W	P53265	400 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	DSL1	P53847	754 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	HSP42	Q12329	375 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	SET6	Q12529	373 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YCR100C	P25606	316 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	PMU1	P36069	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YCR041W	P37265	110 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	PNG1	Q02890	363 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	EFM4	P40516	257 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	MNE1	P24720	663 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	ITR1	P30605	584 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	MMS4	P38257	691 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YHR054C	P38780	354 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	PHO86	P46956	311 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YJL132W	P47014	750 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	NDI1	P32340	513 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	PCA1	P38360	1216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	ALG8	P40351	577 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	VHS2	P40463	436 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	VPS9	P54787	451 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	ODC1	Q03028	310 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF18	YMR078C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	ATR1	P13090	542 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	YDL186W	P48568	277 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	CTR86	P25355	563 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	LTV1	P34078	463 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	RTT107	P38850	1070 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	PIR3	Q03180	325 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	MTR10	Q99189	972 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	CYB2	P00175	591 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	RSM22	P36056	628 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	DCI1	Q08558	271 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	ORT1	Q12375	292 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	AGA1	P32323	725 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	HEL1	P36113	551 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	MED2	Q12124	431 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	RMD5	Q12508	421 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	RRN10	P38204	145 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	MDM31	P38880	579 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	JEM1	P40358	645 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	FRE4	P53746	719 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	CHS1	P08004	1131 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	MDL1	P33310	695 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	FAD1	P38913	306 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	CRZ1	P53968	678 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	AEP3	Q12089	606 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	YJL213W	P40896	331 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF18	YMR078C	POP6	P53218	158 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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