RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C SWC7Q06707 132 aa2.23□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C NOP6Q07623 225 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C NUR1Q12066 484 aa2.23□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C RIO1Q12196 484 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C AVL9Q12500 764 aa2.23□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YGR161W-CQ3E744 92 aa2.23□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C TAO3P40468 2376 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C NUM1Q00402 2748 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C QCR6P00127 147 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C CDC8P00572 216 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C CMD1P06787 147 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C ILV2P07342 687 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MIS1P09440 975 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C IMA3P0CW40 589 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C IMA4P0CW41 589 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C PEP5P12868 1029 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C CBF1P17106 351 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MGT1P26188 188 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C TPS2P31688 896 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C KAR9P32526 644 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C NFU1P32860 256 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C SWE1P32944 819 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YKL097CP34245 136 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C LAS1P36146 502 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MRPL40P36534 297 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YBP1P38315 674 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MSR1P38714 643 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MED6P38782 295 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C HEM14P40012 539 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C SCC4P40090 624 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C INA22P40576 216 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C ERG10P41338 398 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MIC19P43594 170 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C RMD8P43620 662 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C DLD2P46681 530 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C IML2P47031 731 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C TRF5P48561 642 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C TIM13P53299 105 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YPR003CP53394 754 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C COG6P53959 839 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C ENT5Q03769 411 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YLR012CQ07927 99 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C PEX15Q08215 383 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C IMA2Q08295 589 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C AAD15Q08361 143 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YLR112WQ12130 139 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C OCA6Q12454 224 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C AFI1Q99222 893 aa2.22□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C COX5AP00424 153 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RPB2P08518 1224 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ADH4P10127 382 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SST2P11972 698 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C DAL81P21657 970 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MRPL8P22353 238 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C AAT2P23542 418 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C GID7P25569 745 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PTC6P25646 442 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C URA7P28274 579 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C NDI1P32340 513 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RPC37P36121 282 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C APM3P38153 483 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SPP381P38282 291 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YHL041WP38730 149 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SMF2P38778 549 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ARB1P40024 610 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ERR3P42222 437 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ASN2P49090 572 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C VEL1P53058 206 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CPR6P53691 371 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YNR061CP53747 219 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MET14Q02196 202 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RLI1Q03195 608 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C IZH1Q03419 316 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YMR160WQ03823 816 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C LDB18Q07887 179 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C NSE1Q07913 336 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PGC1Q08959 321 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YLR046CQ12253 270 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C LDB17Q12342 491 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PEX11Q12462 236 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MPD2Q99316 277 aa2.21□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TEF1P02994 458 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ARG4P04076 463 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RAD1P06777 1100 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MSF1P08425 469 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SCH9P11792 824 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SEC63P14906 663 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C HEM15P16622 393 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C FPR1P20081 114 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CLN1P20437 546 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RBK1P25332 333 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YCL068CP25593 260 aa2.2□□□□□ -2.06
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