RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637483.1

AC009542.2-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC009542.2, Length 1,189 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009542.2-201ENST00000637483 SHHQ15465 462 aa21.57■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.57■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PPTC7Q8NI37 304 aa21.57■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.57■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.57■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.57■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 LAMA3Q16787 3333 aa21.57■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 ICAM3P32942 547 aa21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 EPHB4P54760 987 aa21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 FPGSQ05932 587 aa21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 MFSD5Q6N075 450 aa21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 KAT2BQ92831 832 aa21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PHKBQ93100 1093 aa21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 LRCH3Q96II8 777 aa21.56■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 FIBPO43427 364 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PPFIA4O75335 1185 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 SCG2P13521 617 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 CYP2C18P33260 490 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 SEMA3FQ13275 785 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 NTRK3Q16288 839 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 NLRX1Q86UT6 975 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 HIPK3Q9H422 1215 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 NID2Q14112 1375 aa21.55■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 NEDD9Q14511 834 aa21.54■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PKN1Q16512 942 aa21.54■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.54■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PGBD1Q96JS3 809 aa21.54■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.54■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.54■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 SEC24BO95487 1268 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 ZNF286BP0CG31 522 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 CYP2C9P11712 490 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 IFNAR1P17181 557 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 ITGB5P18084 799 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 ANAPC15P60006 121 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 STK3Q13188 491 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 TMEM199Q8N511 208 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 ALG1Q9BT22 464 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 TMEM260Q9NX78 707 aa21.53■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 CSF2RAP15509 400 aa21.52■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PSEN2P49810 448 aa21.52■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 CCL23P55773 120 aa21.52■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.52■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.52■■□□□ 1.04
AC009542.2-201ENST00000637483 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.52■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 MFSD10Q14728 455 aa21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 METTL7BQ6UX53 244 aa21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 GPRASP2Q96D09 838 aa21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 JADE2Q9NQC1 790 aa21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 NOD1Q9Y239 953 aa21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 SZT2Q5T011 3432 aa21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.51■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 CPLX1O14810 134 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 ATP9AO75110 1047 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 SP4Q02446 784 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 C7orf31Q8N865 590 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 CDHR1Q96JP9 859 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 ANO3Q9BYT9 981 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 C6orf50Q9HD87 102 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.5■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 ADAMTS3O15072 1205 aa21.49■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 F2P00734 622 aa21.49■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 ACRP10323 421 aa21.49■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 AP3B2Q13367 1082 aa21.49■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 MTMR1Q13613 665 aa21.49■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 PTGISQ16647 500 aa21.49■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.49■■□□□ 1.03
AC009542.2-201ENST00000637483 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms