RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 RAD54LQ92698 747 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 STAMQ92783 540 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 BLZF1Q9H2G9 400 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PXMP2Q9NR77 195 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 AP5Z1O43299 807 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 UBXN2AP68543 259 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP2R5CQ13362 524 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 NCAPHQ15003 741 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 NSMFQ6X4W1 530 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ERMNQ8TAM6 284 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 JADE2Q9NQC1 790 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 KLRC4O43908 158 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGB5P18084 799 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 OSBPP22059 807 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PGM5Q15124 567 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SV2BQ7L1I2 683 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 IL31RAQ8NI17 732 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 RMDN3Q96TC7 470 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 RIT2Q99578 217 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 BTBD7Q9P203 1132 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO40Q9UH90 709 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 CNMDO75829 334 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ADCY5O95622 1261 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ARP10275 920 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 RPA1P27694 616 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 HERVK_113P62684 666 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.685e-6■■■■□ 22.9
CAPNS1-207ENST00000589146 ECM1Q16610 540 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM9Q9C026 710 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 COPB2P35606 906 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MYL5Q02045 173 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MED24O75448 989 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 RHOBTB3O94955 611 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 MUTP22033 750 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PLS1Q14651 629 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNK18Q7Z418 384 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 CCND2P30279 289 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 TPM4P67936 248 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 MCM6Q14566 821 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 UIMC1Q96RL1 719 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 PFASO15067 1338 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 EML1O00423 815 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 GAS7O60861 476 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A27O95847 323 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 KMT5BQ4FZB7 885 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 POTEB3A0JP26 581 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 MYMKA6NI61 221 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 STAM2O75886 525 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 NR3C2P08235 984 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 CETPP11597 493 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF2A2P52657 109 aa25.49■■□□□ 1.67
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