RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 PPTC7Q8NI37 304 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 SEPT8Q92599 483 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-205ENST00000588780 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 CPVLQ9H3G5 476 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 DCTPP1Q9H773 170 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 MUTYHQ9UIF7 546 aa25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-205ENST00000588780 NCK2O43639 380 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-205ENST00000588780 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 TTC14Q96N46 770 aa25.46■■□□□ 1.67
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CAPNS1-205ENST00000588780 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-205ENST00000588780 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-205ENST00000588780 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-205ENST00000588780 HIC1Q14526 733 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-205ENST00000588780 ALX1Q15699 326 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-205ENST00000588780 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-205ENST00000588780 MAF1Q9H063 256 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF318Q5VUA4 2279 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-205ENST00000588780 LTBRP36941 435 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-205ENST00000588780 PTPN5P54829 565 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-205ENST00000588780 COL19A1Q14993 1142 aa25.41■■□□□ 1.66
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CAPNS1-205ENST00000588780 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
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CAPNS1-205ENST00000588780 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 ESR2Q92731 530 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 KAT14Q9H8E8 782 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 H3BRB1 525 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 RB1P06400 928 aa25.37■■□□□ 1.65
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