RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533105.1

NDUFS3-210, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 4

Gene NDUFS3, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-210ENST00000533105 NOD1Q9Y239 953 aa25.21■■□□□ 1.63
NDUFS3-210ENST00000533105 ZNF286BP0CG31 522 aa25.2■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 RCAN1P53805 252 aa25.2■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 NAPAP54920 295 aa25.2■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 FUT2Q10981 343 aa25.2■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.2■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.2■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 ALG1Q9BT22 464 aa25.2■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.2■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.19■■□□□ 1.62
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NDUFS3-210ENST00000533105 TMEM240Q5SV17 173 aa25.19■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.19■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 ZNF365Q70YC5 407 aa25.19■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.19■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.19■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 IL23AQ9NPF7 189 aa25.19■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 FIBPO43427 364 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 PPFIA4O75335 1185 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 ICAM3P32942 547 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 PSEN2P49810 448 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 NLRX1Q86UT6 975 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 SCLYQ96I15 445 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 USP26Q9BXU7 913 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.18■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 SEMA3FQ13275 785 aa25.17■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 MFSD10Q14728 455 aa25.17■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 PTGISQ16647 500 aa25.17■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.17■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 C7orf31Q8N865 590 aa25.17■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 NEDD9Q14511 834 aa25.16■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.16■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.16■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 FAM161BQ96MY7 647 aa25.16■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.16■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 STXBP3O00186 592 aa25.15■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 F2P00734 622 aa25.15■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 ADCY7P51828 1080 aa25.15■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.15■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 RUFY3Q7L099 469 aa25.15■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 SESTD1Q86VW0 696 aa25.15■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 FBXL16Q8N461 479 aa25.15■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 RETREG2Q8NC44 543 aa25.15■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.15■■□□□ 1.62
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NDUFS3-210ENST00000533105 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 SMCO2A6NFE2 343 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 FGBP02675 491 aa25.14■■□□□ 1.62
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NDUFS3-210ENST00000533105 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 METTL7BQ6UX53 244 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 MTMR10Q9NXD2 777 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 BARHL2Q9NY43 387 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.14■■□□□ 1.62
NDUFS3-210ENST00000533105 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 HAS3O00219 553 aa25.13■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 BFSP2Q13515 415 aa25.13■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.13■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 DEFB128Q7Z7B8 93 aa25.13■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 PGBD1Q96JS3 809 aa25.13■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 ITGB5P18084 799 aa25.12■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 GPRASP2Q96D09 838 aa25.12■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 CDHR1Q96JP9 859 aa25.12■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.12■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.12■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 PITPNM1O00562 1244 aa25.11■■□□□ 1.61
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NDUFS3-210ENST00000533105 LGALS2P05162 132 aa25.11■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 SCG2P13521 617 aa25.11■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 MTMR1Q13613 665 aa25.11■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.11■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 HERVK_113Q902F9 699 aa25.11■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 PHKBQ93100 1093 aa25.11■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 GPR20Q99678 358 aa25.11■■□□□ 1.61
NDUFS3-210ENST00000533105 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.11■■□□□ 1.61
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