RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	MECOM	Q03112	1051 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GML	Q99445	158 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC3	Q9BY71	257 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	PALD1	Q9ULE6	856 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEGF11	A6BM72	1044 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPIP5K2	O43314	1243 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF862	O60290	1169 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE3C	Q15386	1083 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPON2	Q9BUD6	331 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CBX8	Q9HC52	389 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHD4	Q14839	1912 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMD14	O00487	310 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CILP	O75339	1184 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAD17	O75943	681 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP7A1	P22680	504 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNNI2	P48788	182 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXCL9	Q07325	125 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAK2	Q13177	524 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEPT6	Q14141	434 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPS37D	Q86XT2	251 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCORL	Q8N3X6	602 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	APPBP2	Q92624	585 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNB2	Q92953	911 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	EYA3	Q99504	573 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARMT1	Q9H993	441 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCF2	Q9UG63	623 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCN9A	Q15858	1988 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CACNA1S	Q13698	1873 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	FZD9	O00144	591 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	F13A1	P00488	732 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	RHBDL3	P58872	404 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	NECTIN1	Q15223	517 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP4K1	Q92918	833 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL17RA	Q96F46	866 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR18	Q9BV38	432 aa		7.35	□□□□□ -1.23

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