RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468247.1

RERE-210, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 2

Gene RERE, Length 414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-210ENST00000468247 TIFAQ96CG3 184 aa24.19■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 HAS3O00219 553 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 F2P00734 622 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 GRIN2CQ14957 1233 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 RNF20Q5VTR2 975 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 SPATA33Q96N06 139 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 ALG1Q9BT22 464 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 UNC80Q8N2C7 3258 aa24.18■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 IQCF3P0C7M6 154 aa24.17■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 MFSD10Q14728 455 aa24.17■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.17■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.17■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.17■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 NOD1Q9Y239 953 aa24.17■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 PIK3CDO00329 1044 aa24.16■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 PITPNM1O00562 1244 aa24.16■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 TGFB3P10600 412 aa24.16■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 HIC1Q14526 733 aa24.16■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.16■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 APOA5Q6Q788 366 aa24.16■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 ZNF576Q9H609 170 aa24.16■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.16■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.16■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.15■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.15■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 ICAM3P32942 547 aa24.15■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.15■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RERE-210ENST00000468247 ZBBXA8MT70 800 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 PPFIA4O75335 1185 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 CPA1P15085 419 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 RABGGTBP53611 331 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 BFSP2Q13515 415 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 GPNMBQ14956 572 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 UBE2SQ16763 222 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 C7orf31Q8N865 590 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 RETREG2Q8NC44 543 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 CUL5Q93034 780 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 WNT8BQ93098 351 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.14■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 TET1Q8NFU7 2136 aa24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 PFKMP08237 780 aa24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 FOSL2P15408 326 aa24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 RFC2P35250 354 aa24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 FUT2Q10981 343 aa24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 GBF1Q92538 1859 aa24.13■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 STAM2O75886 525 aa24.12■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 MYOGP15173 224 aa24.12■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 GNPTABQ3T906 1256 aa24.12■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.12■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 KCNB2Q92953 911 aa24.12■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.12■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 FIBPO43427 364 aa24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 RBL2Q08999 1139 aa24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 CAGE1Q8TC20 777 aa24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 MSRAQ9UJ68 235 aa24.11■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 ZBTB43O43298 467 aa24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 LGALS2P05162 132 aa24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 KRT32Q14532 448 aa24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 RAB30Q15771 203 aa24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 RTN1Q16799 776 aa24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 METTL7BQ6UX53 244 aa24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 GPR20Q99678 358 aa24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.09■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 CKBP12277 381 aa24.09■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 SELPP16109 830 aa24.09■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 ITGB5P18084 799 aa24.09■■□□□ 1.45
RERE-210ENST00000468247 CDC27P30260 824 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms