RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 MLXIPQ9HAP2 919 aa27.51■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.51■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHA6Q9UN73 950 aa27.51■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.51■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 MYH7BA7E2Y1 1941 aa27.51■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 ICAM3P32942 547 aa27.5■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 CCT2P78371 535 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 LRIT3Q3SXY7 679 aa27.5■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 NFRKBQ6P4R8 1299 aa27.5■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa27.5■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 EHMT1Q9H9B1 1298 aa27.5■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.5■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 SMCO2A6NFE2 343 aa27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 FIBPO43427 364 aa27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 SCG2P13521 617 aa27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 SHHQ15465 462 aa27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 MFSD5Q6N075 450 aa27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 NLRX1Q86UT6 975 aa27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 HIPK3Q9H422 1215 aa27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 CYP2C18P33260 490 aa27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 SEMA3FQ13275 785 aa27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 HSDL1Q3SXM5 330 aa27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 C9orf50Q5SZB4 431 aa27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 KAT2BQ92831 832 aa27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 PHKBQ93100 1093 aa27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 LRCH3Q96II8 777 aa27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.48■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 EPHB4P54760 987 aa27.47■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 NEDD9Q14511 834 aa27.47■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM199Q8N511 208 aa27.47■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 LAMA3Q16787 3333 aa27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 PPFIA3O75145 1194 aa27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 PPFIA4O75335 1185 aa27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 FOSP01100 380 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF286BP0CG31 522 aa27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 ANAPC15P60006 121 aa27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 NTRK3Q16288 839 aa27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 BCAS3Q9H6U6 928 aa27.46■■□□□ 1.99
SMKR1-201ENST00000462322 CYP2C9P11712 490 aa27.45■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 IFNAR1P17181 557 aa27.45■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP27.45■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 PKN1Q16512 942 aa27.45■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 CYFIP1Q7L576 1253 aa27.45■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 GPRASP2Q96D09 838 aa27.45■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.45■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 UMODL1Q5DID0 1318 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 NOP56O00567 594 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 CSF2RAP15509 400 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 ITGB5P18084 799 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 PSEN2P49810 448 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 METTL7BQ6UX53 244 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 CDHR1Q96JP9 859 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 PGBD1Q96JS3 809 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 SENP7Q9BQF6 1050 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 ALG1Q9BT22 464 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 NOD1Q9Y239 953 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.44■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 CPLX1O14810 134 aa27.43■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 F2P00734 622 aa27.43■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 STK3Q13188 491 aa27.43■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 AP3B2Q13367 1082 aa27.43■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 MFSD10Q14728 455 aa27.43■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 ANO3Q9BYT9 981 aa27.43■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM260Q9NX78 707 aa27.43■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 CCL23P55773 120 aa27.42■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.42■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM22Q8IYM9 498 aa27.42■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 C7orf31Q8N865 590 aa27.42■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 C6orf50Q9HD87 102 aa27.42■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 ESYT2A0FGR8 921 aa27.41■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 CLK2P49760 499 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 MTMR1Q13613 665 aa27.41■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 PTGISQ16647 500 aa27.41■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.41■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 SESTD1Q86VW0 696 aa27.41■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 ZMYND12Q9H0C1 365 aa27.41■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 JADE2Q9NQC1 790 aa27.41■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 HAS3O00219 553 aa27.4■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 SEC24BO95487 1268 aa27.4■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 SP4Q02446 784 aa27.4■■□□□ 1.98
SMKR1-201ENST00000462322 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 491.1 ms