RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PQ27 194 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PQ64 194 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PQC6 194 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PQD8 194 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 FAM153BP0C7A2 387 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 L1CAMP32004 1257 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 LIMS1P48059 325 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 NCKAP1LP55160 1127 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CYP4F8P98187 520 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 MVKQ03426 396 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 SAPCD2Q86UD0 394 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 IER2Q9BTL4 223 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ARNTLO00327 626 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 NOBOXO60393 691 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 GFRA1P56159 465 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 MBLAC2Q68D91 279 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ZFPM1Q8IX07 1006 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM145Q8NBT3 493 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 KREMEN2Q8NCW0 462 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 NPLOC4Q8TAT6 608 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 C7orf72A4D263 438 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD62A6NC57 917 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 SCG5P05408 212 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TACR1P25103 407 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 INF2Q27J81 1249 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 DENND5AQ6IQ26 1287 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC103Q8IW40 242 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC140Q96MF4 163 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 MMP19Q99542 508 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TMX1Q9H3N1 280 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 GULP1Q9UBP9 304 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 FAN1Q9Y2M0 1017 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PRODHO43272 600 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CPP00450 1065 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 RPTNQ6XPR3 784 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf159Q96HA4 380 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 FEZ1Q99689 392 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 RWDD3Q9Y3V2 267 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.49□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PQJ5 194 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 DLX3O60479 287 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PLATP00750 562 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 FGFR1P11362 822 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 FOXO4P98177 505 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CARFQ8N187 725 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 DIO2Q92813 273 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 RNF38Q9H0F5 515 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 BTG4Q9NY30 223 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 FBLN5Q9UBX5 448 aa4.48□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 NPHS1O60500 1241 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 LCP1P13796 627 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TCEA2Q15560 299 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 FOXB2Q5VYV0 432 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 BICRALQ6AI39 1079 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 NSMFQ6X4W1 530 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 DPF3Q92784 378 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 OSBP2Q969R2 916 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1B0GTL3 188 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 CORO7P57737 925 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 MAP4K2Q12851 820 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.47□□□□□ -1.69
CCDC82-202ENST00000423339 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms