RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340477.9

SYNE4-202, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE4, Length 1,004 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-202ENST00000340477 GGPS1O95749 300 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 NLRP5P59047 1200 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 NEDD9Q14511 834 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 AFG1LQ8WV93 481 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 WASF1Q92558 559 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 GPRASP2Q96D09 838 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.94■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 ARVCFO00192 962 aa21.93■■□□□ 1.1
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SYNE4-202ENST00000340477 RABEP1Q15276 862 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 DGKDQ16760 1214 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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SYNE4-202ENST00000340477 GTF3C6Q969F1 213 aa21.93■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 TOX2Q96NM4 488 aa21.93■■□□□ 1.1
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SYNE4-202ENST00000340477 CLTBP09497 229 aa21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 SYN1P17600 705 aa21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 ZNF76P36508 570 aa21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 MTMR1Q13613 665 aa21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 ITGA7Q13683 1181 aa21.92■■□□□ 1.1
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SYNE4-202ENST00000340477 SPATA33Q96N06 139 aa21.92■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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SYNE4-202ENST00000340477 GALNT17Q6IS24 598 aa21.9■■□□□ 1.1
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SYNE4-202ENST00000340477 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.9■■□□□ 1.1
SYNE4-202ENST00000340477 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.89■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 SORBS3O60504 671 aa21.89■■□□□ 1.09
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SYNE4-202ENST00000340477 METTL7BQ6UX53 244 aa21.89■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.89■■□□□ 1.09
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SYNE4-202ENST00000340477 CHMP4BP1P59074 171 aa21.88■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 PSMC6P62333 389 aa21.88■■□□□ 1.09
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SYNE4-202ENST00000340477 CEP55Q53EZ4 464 aa21.88■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.88■■□□□ 1.09
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SYNE4-202ENST00000340477 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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SYNE4-202ENST00000340477 CDK7P50613 346 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 LTBP2Q14767 1821 aa21.87■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 RAG1P15918 1043 aa21.86■■□□□ 1.09
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SYNE4-202ENST00000340477 TRIM29Q14134 588 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 BLIDQ8IZY5 108 aa21.86■■□□□ 1.09
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SYNE4-202ENST00000340477 SDF4Q9BRK5 362 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 ALG1Q9BT22 464 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.86■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.85■■□□□ 1.09
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SYNE4-202ENST00000340477 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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SYNE4-202ENST00000340477 FAAP100Q0VG06 881 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SYNE4-202ENST00000340477 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.85■■□□□ 1.09
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