RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 RBL2Q08999 1139 aa20.46■□□□□ 0.87
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HDDC3-201ENST00000330334 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.46■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.46■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 C7orf31Q8N865 590 aa20.46■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.46■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.46■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 MSRAQ9UJ68 235 aa20.46■□□□□ 0.87
HDDC3-201ENST00000330334 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.46■□□□□ 0.87
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HDDC3-201ENST00000330334 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.45■□□□□ 0.86
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HDDC3-201ENST00000330334 EYSQ5T1H1 3165 aa20.45■□□□□ 0.86
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HDDC3-201ENST00000330334 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.44■□□□□ 0.86
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HDDC3-201ENST00000330334 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.44■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.44■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.44■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.44■□□□□ 0.86
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HDDC3-201ENST00000330334 CHMP4BP1P59074 171 aa20.43■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 APOA5Q6Q788 366 aa20.43■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 METTL7BQ6UX53 244 aa20.43■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 RASEFQ8IZ41 740 aa20.43■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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HDDC3-201ENST00000330334 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.42■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF286BP0CG31 522 aa20.42■□□□□ 0.86
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HDDC3-201ENST00000330334 SELPP16109 830 aa20.42■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 RCAN1P53805 252 aa20.42■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 PTK7Q13308 1070 aa20.42■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.42■□□□□ 0.86
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HDDC3-201ENST00000330334 MICU3Q86XE3 530 aa20.41■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 ALG1Q9BT22 464 aa20.41■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.41■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.41■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 H3BRB1 525 aa20.4■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 BAIAP3O94812 1187 aa20.4■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 CKBP12277 381 aa20.4■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 HOXC8P31273 242 aa20.4■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 GPNMBQ14956 572 aa20.4■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 NLRX1Q86UT6 975 aa20.4■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.4■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 CDHR1Q96JP9 859 aa20.4■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 SLC9A7Q96T83 725 aa20.4■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
HDDC3-201ENST00000330334 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.4■□□□□ 0.86
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HDDC3-201ENST00000330334 MAFGO15525 162 aa20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 ZBTB43O43298 467 aa20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 CXCL10P02778 98 aa20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 FUT2Q10981 343 aa20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.39■□□□□ 0.85
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HDDC3-201ENST00000330334 GPR20Q99678 358 aa20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.39■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.38■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 DLL1O00548 723 aa20.38■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 LGALS2P05162 132 aa20.38■□□□□ 0.85
HDDC3-201ENST00000330334 RTN1Q16799 776 aa20.38■□□□□ 0.85
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