RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 TBX21Q9UL17 535 aa20.91■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 GRIN2DO15399 1336 aa20.9■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 SYT1P21579 422 aa20.9■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 STXBP2Q15833 593 aa20.9■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.9■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.9■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.9■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.9■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.89■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 NR3C2P08235 984 aa20.89■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 TTLL4Q14679 1199 aa20.89■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.89■□□□□ 0.94
PTX4-201ENST00000293922 C8orf76Q96K31 380 aa20.89■□□□□ 0.94
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PTX4-201ENST00000293922 RAG1P15918 1043 aa20.88■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 CPT1AP50416 773 aa20.88■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 ITGA7Q13683 1181 aa20.88■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.88■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.88■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.88■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.88■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 A6NJR5 290 aa20.87■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 STX6O43752 255 aa20.87■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 CD4P01730 458 aa20.87■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 PSMC6P62333 389 aa20.87■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.87■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 LY6KQ17RY6 165 aa20.87■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 IL31RAQ8NI17 732 aa20.87■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.87■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.87■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 MTMR6Q9Y217 621 aa20.87■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 SHHQ15465 462 aa20.86■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.85■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.85■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 BRD1O95696 1058 aa20.84■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 GUCY1B3Q02153 619 aa20.84■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.84■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.84■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
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PTX4-201ENST00000293922 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.83■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.83■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.83■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.83■□□□□ 0.93
PTX4-201ENST00000293922 MEIS2O14770 477 aa20.82■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 KPNA6O60684 536 aa20.82■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 NPY5RQ15761 445 aa20.82■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 GALNT17Q6IS24 598 aa20.82■□□□□ 0.92
PTX4-201ENST00000293922 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.82■□□□□ 0.92
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