RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.23■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 OATP04181 439 aa25.23■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.23■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 LRRC63Q05C16 580 aa25.23■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa25.23■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.23■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 DISC1Q9NRI5 854 aa25.23■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 A6NJR5 290 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 PLA2G4BP0C869 781 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 STX2P32856 288 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 CEP85LQ5SZL2 805 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 ABI1Q8IZP0 508 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 BSPRYQ5W0U4 402 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 GOLGA8KD6RF30 607 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 ATF2P15336 505 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 FBXO40Q9UH90 709 aa25.22■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 CRKP46108 304 aa25.21■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 ALX1Q15699 326 aa25.21■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 SESTD1Q86VW0 696 aa25.21■■□□□ 1.63
TARBP1-201ENST00000040877 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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TARBP1-201ENST00000040877 CD209Q9NNX6 404 aa25.21■■□□□ 1.63
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TARBP1-201ENST00000040877 PLCG1P19174 1290 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF148Q9UQR1 794 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 CCDC160A6NGH7 325 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 MED7O43513 233 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF131P52739 623 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 CDC23Q9UJX2 597 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 RNF14Q9UBS8 474 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.2■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 RASSF2P50749 326 aa25.19■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 JAK3P52333 1124 aa25.19■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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TARBP1-201ENST00000040877 CRB1P82279 1406 aa25.19■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 ZBED6P86452 979 aa25.19■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 RASSF7Q02833 373 aa25.19■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 BCAP29Q9UHQ4 241 aa25.19■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 AFF2P51816 1311 aa25.19■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.19■■□□□ 1.62
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TARBP1-201ENST00000040877 HSPA6P17066 643 aa25.18■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 ZBTB5O15062 677 aa25.18■■□□□ 1.62
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TARBP1-201ENST00000040877 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.18■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 EHHADHQ08426 723 aa25.18■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 BBS5Q8N3I7 341 aa25.18■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 PPP4R1Q8TF05 950 aa25.18■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.18■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.18■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 SNX25Q9H3E2 840 aa25.18■■□□□ 1.62
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TARBP1-201ENST00000040877 MXI1P50539 228 aa25.17■■□□□ 1.62
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TARBP1-201ENST00000040877 C21orf2O43822 256 aa25.17■■□□□ 1.62
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TARBP1-201ENST00000040877 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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TARBP1-201ENST00000040877 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.17■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.16■■□□□ 1.62
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TARBP1-201ENST00000040877 MESDQ14696 234 aa25.16■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 NAA25Q14CX7 972 aa25.16■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 NME8Q8N427 588 aa25.16■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 MED4Q9NPJ6 270 aa25.16■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 FAM114A2Q9NRY5 505 aa25.16■■□□□ 1.62
TARBP1-201ENST00000040877 FEM1BQ9UK73 627 aa25.16■■□□□ 1.62
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