RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 E9PMD0 336 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 RHOBTB3O94955 611 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 ARHGAP25P42331 645 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 STIM1Q13586 685 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 SEPT2Q15019 361 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 FCHSD1Q86WN1 690 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 P2RX5Q93086 422 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CALML4Q96GE6 196 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 ZMYND10O75800 440 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 TTLL1O95922 423 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 APBA3O96018 575 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 GABPAQ06546 454 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 LAMB1P07942 1786 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CCDC189A1A4V9 331 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 JAG1P78504 1218 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 ZNF543Q08ER8 600 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 BIRC2Q13490 618 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 LGALS16A8MUM7 142 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CRKP46108 304 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 DNA2P51530 1060 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 SV2BQ7L1I2 683 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 SP8Q8IXZ3 490 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 DDX12PQ92771 950 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 NDUFA10O95299 355 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 MCTP2Q6DN12 878 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 RPAINQ86UA6 219 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 PSTPIP2Q9H939 334 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 EFCAB8A8MWE9 144 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CHMP4BP1P59074 171 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 UBXN2AP68543 259 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 SLF2Q8IX21 1173 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 TEKT1Q969V4 418 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 PNKPQ96T60 521 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 LZTS2Q9BRK4 669 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 SLC1A4P43007 532 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 SPAG1Q07617 926 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 HAS1Q92839 578 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 MTMR9Q96QG7 549 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 COA1Q9GZY4 146 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 POTEB3A0JP26 581 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 POTECB2RU33 542 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 ZNF185O15231 689 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 ARID5AQ03989 594 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CCDC122Q5T0U0 273 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 POTEBQ6S5H4 581 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 TMTC1Q8IUR5 882 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 MED4Q9NPJ6 270 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 ADAM21Q9UKJ8 722 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CTAGE9A4FU28 777 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CCNE1P24864 410 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 HERVK_113P62684 666 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 AOC3Q16853 763 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 LEKR1Q6ZMV7 388 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.72■□□□□ 0.27
CTIF-205ENST00000587860 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms