RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 NTSR2O95665 410 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ECHS1P30084 290 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 SKOR1P84550 965 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 GDF3Q9NR23 364 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A087X0T9 212 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC37A4O43826 429 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP2C2O75185 946 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM228BP0C875 321 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CALM1P0DP23 149 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CALM2P0DP24 149 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CALM3P0DP25 149 aa7.56□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 GRB10Q13322 594 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CENPPQ6IPU0 288 aa7.56□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 TBC1D5Q92609 795 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PNMA5Q96PV4 448 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 NUP58Q9BVL2 599 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 YY1AP1Q9H869 796 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 BTG4Q9NY30 223 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 E7EVH7 732 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNM1LO00429 736 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 USO1O60763 962 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 LCA5LO95447 670 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACTN1P12814 892 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERVK-9P63128 1117 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAVIN3Q969G5 261 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 RUFY1Q96T51 708 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLAAQ9Y263 795 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1W2PQJ5 194 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAMTA2O94983 1202 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDHBP11177 359 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 NR1D1P20393 614 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 GSCP56915 257 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PTGISQ16647 500 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CFAP58Q5T655 872 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 EMBQ6PCB8 327 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 TBCKQ8TEA7 893 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 EPN3Q9H201 632 aa7.56□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 H0YHG0 523 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 OPLAHO14841 1288 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 OPA1O60313 960 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 TDP2O95551 362 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ITGA4P13612 1032 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDK17Q00537 523 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ITPK1Q13572 414 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 NLRP14Q86W24 1093 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM228AQ86W67 206 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 RETREG2Q8NC44 543 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM212AQ96EL1 285 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 BARHL2Q9NY43 387 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRP5O75197 1615 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP1R37O75864 691 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRLRP16471 622 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCP1P17987 556 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 COPB2P35606 906 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALS2CLQ60I27 953 aa7.55□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDXDC1Q6P996 788 aa7.55□□□□□ -1.2
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