RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508394.6

SMUG1-215, Transcript of single-strand-selective monofunctional uracil-DNA glycosylase 1, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SMUG1, Length 1,697 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMUG1-215	ENST00000508394		B4DLN1	442 aa		24.8	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	24.8	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	24.8	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	STXBP2	Q15833	593 aa		24.8	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	MCTP2	Q6DN12	878 aa		24.8	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	FERMT3	Q86UX7	667 aa		24.8	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		24.8	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	24.8	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	MORC4	Q8TE76	937 aa		24.8	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	STX6	O43752	255 aa		24.79	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	24.79	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		24.79	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	24.79	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	24.79	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	ACVR2B	Q13705	512 aa		24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	PKP1	Q13835	747 aa		24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	TRPV1	Q8NER1	839 aa		24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	KATNBL1	Q9H079	304 aa		24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	MTMR6	Q9Y217	621 aa		24.78	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	24.77	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	ATP2B1	P20020	1258 aa		24.77	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	CNGA1	P29973	690 aa		24.77	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	24.77	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	ZNF76	P36508	570 aa		24.77	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	24.77	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		24.77	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		24.77	■■□□□ 1.56
SMUG1-215	ENST00000508394	RGS20	O76081	388 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	CYBA	P13498	195 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	24.76	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	LETM2	Q2VYF4	491 aa		24.76	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	EDIL3	O43854	480 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	UIMC1	Q96RL1	719 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	VTA1	Q9NP79	307 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	FAM86B1	E9PN63	330 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	ITGB5	P18084	799 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	PTGS1	P23219	599 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	MTFR1	Q15390	333 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	ANO1	Q5XXA6	986 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	NEK8	Q86SG6	692 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		24.75	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	WNT7A	O00755	349 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	TDP2	O95551	362 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	24.74	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		24.74	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	24.73	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	CYP3A4	P08684	503 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	CEP55	Q53EZ4	464 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		24.73	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	SORBS3	O60504	671 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	NBR1	Q14596	966 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	PRR16	Q569H4	304 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	ADCY6	O43306	1168 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	ARIH2	O95376	493 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	USP11	P51784	963 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	ZNF333	Q96JL9	665 aa		24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	24.72	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	STAM2	O75886	525 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	REST	Q13127	1097 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	SEMA3F	Q13275	785 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	MTMR1	Q13613	665 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	NLRX1	Q86UT6	975 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	SCFD2	Q8WU76	684 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	JADE2	Q9NQC1	790 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		24.71	■■□□□ 1.55
SMUG1-215	ENST00000508394	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	24.7	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	AR	P10275	920 aa		24.7	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	CCL5	P13501	91 aa		24.7	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	LY6K	Q17RY6	165 aa		24.7	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		24.7	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		24.7	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	ARMC5	Q96C12	935 aa		24.7	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		24.7	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	24.7	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		24.69	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	MEIS1	O00470	390 aa		24.69	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	SEPT4	O43236	478 aa		24.69	■■□□□ 1.54
SMUG1-215	ENST00000508394	SLC37A4	O43826	429 aa		24.69	■■□□□ 1.54

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