RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488297.2

RPS3AP22-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 22, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP22, Length 769 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP22-201ENST00000488297 SEC14L1Q92503 715 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 TMEM169Q96HH4 297 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 SGSM2O43147 1006 aa6.76□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 TRIM13O60858 407 aa6.76□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 FGFR1P11362 822 aa6.76□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 CAP1Q01518 475 aa6.76□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 LSAMPQ13449 338 aa6.76□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 ARMC5Q96C12 935 aa6.76□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 H7BY64 318 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 PDPK1O15530 556 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 INHBBP09529 407 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 BMP7P18075 431 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 HTRA3P83110 453 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 VMACQ2NL98 169 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 KCNC2Q96PR1 638 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 GPR27Q9NS67 375 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.75□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 PRODHO43272 600 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 RASGRF1Q13972 1273 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 VWA3BQ502W6 1294 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 LCE4AQ5TA78 99 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 USP53Q70EK8 1073 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 MIB1Q86YT6 1006 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 OSBP2Q969R2 916 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 CLDND1Q9NY35 253 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 PALD1Q9ULE6 856 aa6.74□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 FFAR3O14843 346 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 NSMFQ6X4W1 530 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 SPATC1Q76KD6 591 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 C8BP07358 591 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 CHRNA2Q15822 529 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 MTERF2Q49AM1 385 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 SP8Q8IXZ3 490 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 CDIP1Q9H305 208 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP22-201ENST00000488297 MSCO60682 206 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 CYP2C8P10632 490 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 SERINC3Q13530 473 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 NTRK3Q16288 839 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 DCAF4Q8WV16 495 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 ADCY3O60266 1144 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 DGKIO75912 1065 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 SASH1O94885 1247 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 HOXA5P20719 270 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 RBL2Q08999 1139 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 EMC4Q5J8M3 183 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 STEAP3Q658P3 488 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 STYK1Q6J9G0 422 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 DDX11Q96FC9 970 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 NOX5Q96PH1 765 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 BLACEA4D250 179 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 SH3D21A4FU49 640 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 RASA3Q14644 834 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP22-201ENST00000488297 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms