RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 B4DLN1 442 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 KPNA6O60684 536 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 GH1P01241 217 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 CYP21A2P08686 494 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 IGFBP4P22692 258 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 NT5C2P49902 561 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 KAT2BQ92831 832 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PXMP2Q9NR77 195 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PTPRSQ13332 1948 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 NR3C2P08235 984 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 IQCF3P0C7M6 154 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 CHMLP26374 656 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 HSD17B4P51659 736 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PTGISQ16647 500 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 HOMER1Q86YM7 354 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 IL31RAQ8NI17 732 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 MTMR8Q96EF0 704 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 IWS1Q96ST2 819 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 AMNQ9BXJ7 453 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 TRANK1O15050 2925 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 RGS20O76081 388 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 ZNF286BP0CG31 522 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 RETREG2Q8NC44 543 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PIGSQ96S52 555 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 ALG1Q9BT22 464 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 NOD1Q9Y239 953 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 RFXAPO00287 272 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PITPNM1O00562 1244 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB5O15062 677 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 CYTH3O43739 400 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF15O94989 841 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PFKMP08237 780 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 GRM4Q14833 912 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 GPNMBQ14956 572 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 CERS4Q9HA82 394 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 E7EWF7 191 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 CA3P07451 260 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PSEN2P49810 448 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 ANTXR2P58335 489 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 SP2Q02086 613 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 TRDNQ13061 729 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 BFSP2Q13515 415 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 DGKDQ16760 1214 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 TCTN1Q2MV58 587 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 SPRED2Q7Z698 418 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 WNT8BQ93098 351 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 MAF1Q9H063 256 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 MUC3AQ02505 3323 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 TTC28Q96AY4 2481 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 EPOPA6NHQ4 379 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 SGSM2O43147 1006 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 ACTN1P12814 892 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 RFC2P35250 354 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 GHRHRQ02643 423 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 HIC1Q14526 733 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 MFSD10Q14728 455 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 PGM5Q15124 567 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 SESTD1Q86VW0 696 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-212ENST00000485532 GGPS1O95749 300 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAME-212ENST00000485532 TROAPQ12815 778 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAME-212ENST00000485532 WTAPQ15007 396 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms