RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 M0R2N6 131 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 LDHBP07195 334 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PRPHP41219 470 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 GRIK5Q16478 980 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP58Q5T655 872 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 EMC10Q5UCC4 262 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 IQCKQ8N0W5 287 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TLR10Q9BXR5 811 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 GDF3Q9NR23 364 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TSKSQ9UJT2 592 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 NCK2O43639 380 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 KRT14P02533 472 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PLCG1P19174 1290 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MAGEA1P43355 309 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ATP1A2P50993 1020 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 KCTD16Q68DU8 428 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MICALCLQ6ZW33 695 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MKNK2Q9HBH9 465 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 RNF14Q9UBS8 474 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 FLT1P17948 1338 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 LAMB1P07942 1786 aa16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 EPHB6O15197 1021 aa16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 LSP1P33241 339 aa16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ASIC1P78348 528 aa16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PAK2Q13177 524 aa16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP221Q4G0U5 840 aa16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 VWA3BQ502W6 1294 aa16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 MREGQ8N565 214 aa16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 EPN3Q9H201 632 aa16.52■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CABP7Q86V35 215 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CD302Q8IX05 232 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CABS1Q96KC9 395 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 AK8Q96MA6 479 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SALL4Q9UJQ4 1053 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L3A6NCW0 530 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L4A6NCW7 530 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 FCER1AP12319 257 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 RCSD1Q6JBY9 416 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 STAG2Q8N3U4 1231 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 NOX5Q96PH1 765 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 NDST4Q9H3R1 872 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 USP21Q9UK80 565 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.51■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF233A6NK53 670 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 H0YHG0 523 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 INF2Q27J81 1249 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 NAA35Q5VZE5 725 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 NFU1Q9UMS0 254 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CASZ1Q86V15 1759 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC53A6NM62 1247 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 GLI1P08151 1106 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 NR1D1P20393 614 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 MAN2A1Q16706 1144 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SBK1Q52WX2 424 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CENPPQ6IPU0 288 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 RRAGAQ7L523 313 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 GPATCH11Q8N954 259 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CNBD1Q8NA66 436 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PNMA1Q8ND90 353 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 MTMR8Q96EF0 704 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ABCB11O95342 1321 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R37O75864 691 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-206ENST00000436282 FAM153BP0C7A2 387 aa16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms