RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 CKBP12277 381 aa22.78■■□□□ 1.24
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LTB-210ENST00000429299 SMC5Q8IY18 1101 aa22.78■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.78■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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LTB-210ENST00000429299 GH1P01241 217 aa22.77■■□□□ 1.24
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LTB-210ENST00000429299 TOMM22Q9NS69 142 aa22.76■■□□□ 1.23
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LTB-210ENST00000429299 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
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LTB-210ENST00000429299 SAMD11Q96NU1 681 aa22.69■■□□□ 1.22
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LTB-210ENST00000429299 ABCB11O95342 1321 aa22.68■■□□□ 1.22
LTB-210ENST00000429299 DCXO43602 365 aa22.68■■□□□ 1.22
LTB-210ENST00000429299 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
LTB-210ENST00000429299 MX1P20591 662 aa22.68■■□□□ 1.22
LTB-210ENST00000429299 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.68■■□□□ 1.22
LTB-210ENST00000429299 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.68■■□□□ 1.22
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