RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416748.1

NUP35P2-201, Transcript of nucleoporin 35 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene NUP35P2, Length 943 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35P2-201ENST00000416748 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 SGSM3Q96HU1 749 aa5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 LRRC3Q9BY71 257 aa5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 CHST7Q9NS84 486 aa5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 HOMER2Q9NSB8 354 aa5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 PPT2Q9UMR5 302 aa5.68□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 CLEC3AO75596 197 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 ATE1O95260 518 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 BMP8BP34820 402 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 CCNFP41002 786 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 MC3RP41968 323 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 NKD1Q969G9 470 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 C8orf48Q96LL4 319 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 PLAAQ9Y263 795 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.67□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 AMHP03971 560 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 GIPRP48546 466 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 NR1I3Q14994 352 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 TCEA2Q15560 299 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 ZNF575Q86XF7 245 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 TICAM2Q86XR7 235 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 JMYQ8N9B5 988 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 CNNM2Q9H8M5 875 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 ST7Q9NRC1 585 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 IMPACTQ9P2X3 320 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 EID1Q9Y6B2 187 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 ROBO2Q9HCK4 1378 aa5.66□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 MEIS1O00470 390 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 CTSKP43235 329 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 MTERF2Q49AM1 385 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 JMJD8Q96S16 334 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 PRR13Q9NZ81 148 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.65□□□□□ -1.5
NUP35P2-201ENST00000416748 LTBP3Q9NS15 1303 aa5.65□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 RHBDL3P58872 404 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 FXNQ16595 210 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 SEZ6Q53EL9 994 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 SRGAP3O43295 1099 aa5.63□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 KCNQ2O43526 872 aa5.63□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 VAV1P15498 845 aa5.63□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 CNGA1P29973 690 aa5.63□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 ATG4CQ96DT6 458 aa5.63□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 CRBNQ96SW2 442 aa5.63□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.63□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 CREB3O43889 395 aa5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 ASMTLO95671 621 aa5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 RTP2Q5QGT7 225 aa5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 JAMLQ86YT9 394 aa5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 NAT16Q8N8M0 369 aa5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 SLC6A18Q96N87 628 aa5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.62□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A1W2PQ27 194 aa5.61□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A1W2PQ64 194 aa5.61□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A1W2PQC6 194 aa5.61□□□□□ -1.51
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A1W2PQD8 194 aa5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms