RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 TLR6Q9Y2C9 796 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 GCP02774 474 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZSWIM3Q96MP5 696 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 MTA3Q9BTC8 594 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 PARPBPQ9NWS1 579 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 SIT1Q9Y3P8 196 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 F13A1P00488 732 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 NTRK1P04629 796 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 LMNB2Q03252 620 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 Q6ZSN1 163 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZAR1LA6NP61 321 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 CD3EP07766 207 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 STAT5AP42229 794 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAC3P60763 192 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 STRIP1Q5VSL9 837 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 EEF1DP3Q658K8 133 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 Q6ZPA2 131 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAREM2Q75VX8 874 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 C7orf61Q8IZ16 206 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHC3Q8NDX5 983 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEC14L1Q92503 715 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM209Q96SK2 561 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 GULP1Q9UBP9 304 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 MPP2Q14168 576 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 TPRNQ4KMQ1 711 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 OVOS1Q6IE37 1185 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 RCSD1Q6JBY9 416 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 REC114Q7Z4M0 266 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC6A18Q96N87 628 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 IFNGR1P15260 489 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRM7Q14831 915 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 CR1LQ2VPA4 569 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 NLRC3Q7RTR2 1065 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 MILR1Q7Z6M3 343 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNNM2Q9H8M5 875 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 SGSM2O43147 1006 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPHS1O60500 1241 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 FUCA1P04066 466 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAPK1P28482 360 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 Q6ZUG5 572 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-187P-201ENST00000384139 CR2P20023 1033 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 PROZP22891 400 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 HHEXQ03014 270 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM192Q8IY95 271 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPR150Q8NGU9 434 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 NUDT11Q96G61 164 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 AJUBAQ96IF1 538 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 DHRS1Q96LJ7 313 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR14A2Q96R54 314 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 CEP72Q9P209 647 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 WWC3Q9ULE0 1092 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 FHOD1Q9Y613 1164 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 CARNS1A5YM72 827 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 PF4P02776 101 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTGS2P35354 604 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC6A11P48066 632 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 REXO1L1PQ8IX06 675 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 FIBCD1Q8N539 461 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATG4CQ96DT6 458 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 OAZ3Q9UMX2 235 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 H0Y858 1186 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYP27B1O15528 508 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms