RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320159.2

ZNF48-201, Transcript of zinc finger protein 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF48, Length 3,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48-201ENST00000320159 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.98■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.98■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.98■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.98■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.98■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 USP21Q9UK80 565 aa22.98■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 SLC1A4P43007 532 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 KCNB1Q14721 858 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 FTCDO95954 541 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 KIF11P52732 1056 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 CYP4A11Q02928 519 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 TRIM14Q14142 442 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 BARGINQ6ZT62 677 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 CERS5Q8N5B7 392 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 USP40Q9NVE5 1235 aa22.97■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 SCN7AQ01118 1682 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 SFI1A8K8P3 1242 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 G3V3G9 751 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 ZBED6P86452 979 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 ACTN1P12814 892 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 VWA3BQ502W6 1294 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.96■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 KRT79Q5XKE5 535 aa22.95■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
ZNF48-201ENST00000320159 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 KRT83P78385 493 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 MSL1Q68DK7 614 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 GGCXP38435 758 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 USP14P54578 494 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 UBXN2AP68543 259 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 RAB21Q9UL25 225 aa22.95■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 POTEFA5A3E0 1075 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 RNF40O75150 1001 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 GDF11O95390 407 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 POTEIP0CG38 1075 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 POTEGQ6S5H5 508 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 BICDL2A1A5D9 508 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 FECHP22830 423 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 GPS2Q13227 327 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 TRADDQ15628 312 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 MAGEA1P43355 309 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 MTMR8Q96EF0 704 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 PSMD14O00487 310 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 PSMC6P62333 389 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 A0A1W2PQC6 194 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 PPP4CP60510 307 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 AMPD3Q01432 767 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 HAS1Q92839 578 aa22.92■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.92■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.263e-7■■□□□ 12.7
ZNF48-201ENST00000320159 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.92■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 IFT81Q8WYA0 676 aa22.92■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.92■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.92■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 CASP5P51878 434 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 CCDC181Q5TID7 509 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 KCTD16Q68DU8 428 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 KSR1Q8IVT5 923 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 MTMR9Q96QG7 549 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 PANK4Q9NVE7 773 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 LAMB2P55268 1798 aa22.91■■□□□ 1.26
ZNF48-201ENST00000320159 GYS1P13807 737 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.2 ms