RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 FGD4Q96M96 766 aa21.11■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.11■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.11■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 CFAP45Q9UL16 551 aa21.11■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 MCM3APO60318 1980 aa21.11■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 POTEB2H3BUK9 544 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 ADORA2AP29274 412 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 KCTD2Q14681 263 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 PGM5Q15124 567 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 IL17AQ16552 155 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 RNF214Q8ND24 703 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 RPTORQ8N122 1335 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 SPTLC2O15270 562 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 MAP2K2P36507 400 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 SLC39A14Q15043 492 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 PRR16Q569H4 304 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.1■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF76P36508 570 aa21.09■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.09■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.09■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 ME1P48163 572 aa21.08■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 TRAPPC10P48553 1259 aa21.08■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.08■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.08■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.08■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.08■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PRRT1-201ENST00000211413 PFASO15067 1338 aa21.08■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.08■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 NR3C2P08235 984 aa21.08■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 ITGB5P18084 799 aa21.08■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 PTPREP23469 700 aa21.08■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 LENG9Q96B70 501 aa21.08■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 HTTP42858 3142 aa21.07■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.07■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 OFD1O75665 1012 aa21.07■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 ALDH1A1P00352 501 aa21.07■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 ARP10275 920 aa21.07■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 USP11P51784 963 aa21.07■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.07■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.07■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 NEMFO60524 1076 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 YEATS4O95619 227 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 CDC25AP30304 524 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 HAS1Q92839 578 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 SORBS3O60504 671 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 CYP3A4P08684 503 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 ATL3Q6DD88 541 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 USP49Q70CQ1 688 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 MGAMO43451 1857 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 RGS20O76081 388 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 MAPK4P31152 587 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 COPB2P35606 906 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 TXKP42681 527 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 ELP1O95163 1332 aa21.05■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 PTGS1P23219 599 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 PSMC4P43686 418 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 GRB14Q14449 540 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 CALCRLQ16602 461 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 DPP9Q86TI2 863 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM47Q96LD4 638 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 PP2D1A8MPX8 630 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 MSH4O15457 936 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 CYP3A7P24462 503 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 CIITAP33076 1130 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 CEP55Q53EZ4 464 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 MCTP2Q6DN12 878 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 MTMR9Q96QG7 549 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 CSRNP2Q9H175 543 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.04■□□□□ 0.96
PRRT1-201ENST00000211413 GABRQQ9UN88 632 aa21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms