RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ube2q1Q7TSS2 422 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lmcd1Q8VEE1 365 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ndufv1Q91YT0 464 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Srgap1Q91Z69 1062 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Smc1bQ920F6 1248 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 HlcsQ920N2 722 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rbm43Q99J64 343 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kcnmb2Q9CZM9 235 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sapcd2Q9D818 391 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 SelenooQ9DBC0 667 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bcorl1A2AQH4 1781 aa9.08□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm9857F7CXR1 130 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mboat4P0C7A3 435 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ptpn22P29352 802 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nedd1P33215 660 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Col19a1Q0VF58 1136 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Samd5Q3V1H9 173 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bahd1Q497V6 772 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zbtb39Q6PDK0 712 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rab15Q8K386 212 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Defb15Q8R2I5 79 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tdrd1Q99MV1 1172 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bco2Q99NF1 532 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vta1Q9CR26 309 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prkab1Q9R078 270 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PfkpQ9WUA3 784 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cep350E9Q309 3095 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Igsf9bE9PZ19 1328 aa9.07□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rexo5D3YW29 759 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pnmal2G3X9N3 661 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gfra3O35118 397 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 CrcpO35427 148 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mybl2P48972 704 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Eme2Q56A04 373 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hs3st6Q5GFD5 342 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 GpamQ61586 827 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 E4f1Q8CCE9 783 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pof1bQ8K4L4 587 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc18a1Q8R090 521 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Psmd2Q8VDM4 908 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dcp1aQ91YD3 602 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Armcx1Q9CX83 456 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Alpk1Q9CXB8 1231 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rad9aQ9Z0F6 389 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Piezo2Q8CD54 2822 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 RptorQ8K4Q0 1335 aa9.06□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wfdc16A2A5H4 111 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kcnb2A6H8H5 907 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Skint3A7TZF0 458 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hoxc10P31257 342 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 CtskP55097 329 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Znf667Q2TL60 609 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fscn2Q32M02 492 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zfp90Q61967 636 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MylipQ8BM54 445 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lmbrd2Q8C561 694 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ak5Q920P5 562 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ctu1Q99J10 420 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ankrd1Q9CR42 319 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ube2fQ9CY34 185 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Appbp2Q9DAX9 585 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Btnl4A2CG29 586 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wisp1O54775 367 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc6a20bO88575 635 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gp6P0C191 313 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bmp4P21275 408 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cfap52Q5F201 620 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 IqceQ6PCQ0 778 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Adamtsl4Q80T21 1036 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Adgra1Q8C4G9 578 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ttc8Q8VD72 515 aa9.05□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Aoc3O70423 765 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Abl1P00520 1123 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dpf3P58269 378 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tial1P70318 392 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atp11aP98197 1187 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ttll4Q80UG8 1193 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Brf1Q8CFK2 676 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trib2Q8K4K3 343 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bmp2kQ91Z96 1138 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Eid1Q9DCR4 169 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Efcc1Q9JJF6 558 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa9.04□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ano3A2AHL1 981 aa9.03□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pramef17A2ASJ1 475 aa9.03□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zfp994J3QM38 661 aa9.03□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Esyt3Q5DTI8 891 aa9.03□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sp4Q62445 782 aa9.03□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa9.03□□□□□ -0.96
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cyp26b1Q811W2 512 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.5 ms