Protein–RNA interactions for Protein: Q9D818

Sapcd2, Suppressor APC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sapcd2Q9D818 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
Sapcd2Q9D818 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Sapcd2Q9D818 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Sapcd2Q9D818 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Sapcd2Q9D818 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Sapcd2Q9D818 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Sapcd2Q9D818 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Sapcd2Q9D818 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Sapcd2Q9D818 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Sapcd2Q9D818 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Sapcd2Q9D818 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Sapcd2Q9D818 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Sapcd2Q9D818 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Sapcd2Q9D818 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Sapcd2Q9D818 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Sapcd2Q9D818 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Sapcd2Q9D818 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Sapcd2Q9D818 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Sapcd2Q9D818 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sapcd2Q9D818 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sapcd2Q9D818 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Sapcd2Q9D818 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Sapcd2Q9D818 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sapcd2Q9D818 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Sapcd2Q9D818 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Sapcd2Q9D818 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Sapcd2Q9D818 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Sapcd2Q9D818 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Sapcd2Q9D818 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Sapcd2Q9D818 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Sapcd2Q9D818 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sapcd2Q9D818 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Sapcd2Q9D818 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Sapcd2Q9D818 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Sapcd2Q9D818 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Sapcd2Q9D818 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Sapcd2Q9D818 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sapcd2Q9D818 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Sapcd2Q9D818 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sapcd2Q9D818 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sapcd2Q9D818 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sapcd2Q9D818 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sapcd2Q9D818 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Sapcd2Q9D818 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Sapcd2Q9D818 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Sapcd2Q9D818 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Sapcd2Q9D818 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sapcd2Q9D818 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sapcd2Q9D818 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Sapcd2Q9D818 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sapcd2Q9D818 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Sapcd2Q9D818 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sapcd2Q9D818 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sapcd2Q9D818 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sapcd2Q9D818 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sapcd2Q9D818 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Sapcd2Q9D818 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sapcd2Q9D818 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sapcd2Q9D818 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sapcd2Q9D818 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sapcd2Q9D818 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sapcd2Q9D818 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Sapcd2Q9D818 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sapcd2Q9D818 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sapcd2Q9D818 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sapcd2Q9D818 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sapcd2Q9D818 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sapcd2Q9D818 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Sapcd2Q9D818 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sapcd2Q9D818 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sapcd2Q9D818 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sapcd2Q9D818 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sapcd2Q9D818 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Sapcd2Q9D818 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sapcd2Q9D818 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sapcd2Q9D818 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sapcd2Q9D818 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sapcd2Q9D818 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Sapcd2Q9D818 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Sapcd2Q9D818 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Sapcd2Q9D818 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sapcd2Q9D818 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sapcd2Q9D818 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sapcd2Q9D818 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sapcd2Q9D818 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Sapcd2Q9D818 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sapcd2Q9D818 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sapcd2Q9D818 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sapcd2Q9D818 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sapcd2Q9D818 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sapcd2Q9D818 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sapcd2Q9D818 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sapcd2Q9D818 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Sapcd2Q9D818 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sapcd2Q9D818 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sapcd2Q9D818 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sapcd2Q9D818 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sapcd2Q9D818 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Sapcd2Q9D818 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sapcd2Q9D818 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms