RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	SCEI	P03882	235 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SDH2	P21801	266 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MGR1	P25573	417 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	NDI1	P32340	513 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SIP1	P32578	815 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SPC34	P36131	295 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PET10	P36139	283 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	FMP23	P38231	175 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YIR035C	P40579	254 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	HHO1	P53551	258 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ARP4	P80428	489 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	JIP4	Q03361	876 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CSN9	Q03981	162 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SND1	Q04007	877 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YET3	Q07451	203 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	THI73	Q07904	523 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	BI4	P03879	638 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MOD5	P07884	428 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	HOM3	P10869	527 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	UGA1	P17649	471 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PPH22	P23595	377 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CTS1	P29029	562 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	DBF4	P32325	704 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	DAL1	P32375	460 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	COQ2	P32378	372 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ECM25	P32525	599 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	FRE1	P32791	686 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	LST4	P34239	828 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SCO2	P38072	301 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	VPS29	P38759	282 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YHR131C	P38835	850 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MAD2	P40958	196 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	DOC1	P53068	250 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YNR062C	P53748	327 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	AIM36	Q03798	255 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CDA2	Q06703	312 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	THI3	Q07471	609 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	IMA2	Q08295	589 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	FRE3	Q08905	711 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SRN2	Q99176	213 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PHO5	P00635	467 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	REP2	P03872	296 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
SKG6	YHR149C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MSS18	P08593	268 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ENA1	P13587	1091 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	UBC8	P28263	218 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ATP7	P30902	174 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RNP1	P32385	249 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SCM4	P32564	187 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ISC10	P32645	267 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	UGA4	P32837	571 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RGT1	P32862	1170 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SPO23	P33757	523 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	APN2	P38207	520 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SUL1	P38359	859 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	OSH7	P38755	437 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YAP1801	P38856	637 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YJL206C	P39529	758 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	UBP5	P39944	805 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YER010C	P40011	234 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ICP55	P40051	511 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GYP8	P43570	497 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SAE2	P46946	345 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CTR1	P49573	406 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ERV14	P53173	138 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	JAC1	P53193	184 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	POP6	P53218	158 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
SKG6	YHR149C	NIS1	P53939	407 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	HDA1	P53973	706 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	STP1	Q00947	519 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ATG16	Q03818	150 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74

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