RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA20Q8TB22 786 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ATG4CQ96DT6 458 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PAGE5Q96GU1 130 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CFBP00751 764 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB34Q9BZG1 259 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CBX8Q9HC52 389 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 DISC1Q9NRI5 854 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXN1O15353 648 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC26A4O43511 780 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 TECP42680 631 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 TXKP42681 527 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CABP7Q86V35 215 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CUEDC2Q9H467 287 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 RPTORQ8N122 1335 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF165P49910 485 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PPIL2Q13356 520 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 LENG9Q96B70 501 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PP2D1A8MPX8 630 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR29P0C7W0 189 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 IQCB1Q15051 598 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 TKFCQ3LXA3 575 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 CPXCR1Q8N123 301 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM20AQ96MK3 541 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ELP3Q9H9T3 547 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGEF1Q9HAY2 307 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 SMC2O95347 1197 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ALAS1P13196 640 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC25AP30304 524 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
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CAPNS1-207ENST00000589146 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 SMARCE1Q969G3 411 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 NFIBO00712 420 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 STAT6P42226 847 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 DPYDQ12882 1025 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MOB2Q70IA6 237 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 WNK4Q96J92 1243 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM86B1E9PN63 330 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 IRF6O14896 467 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MYL1P05976 194 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MORC3Q14149 939 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR16Q569H4 304 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 CALML4Q96GE6 196 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 PDLIM2Q96JY6 352 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 GSDMAQ96QA5 445 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MTRQ99707 1265 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 BIN1O00499 593 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-207ENST00000589146 MARCH6O60337 910 aa25.65■■□□□ 1.7
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