RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	RBSN	Q9H1K0	784 aa		5	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		5	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		5	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		5	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	RTL9	Q8NET4	1388 aa		5	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		5	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SH3BP5	O60239	455 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	GREM1	O60565	184 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	EDN3	P14138	238 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SOX5	P35711	763 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF165	P49910	485 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	HUNK	P57058	714 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	LMNB2	Q03252	620 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	GRM2	Q14416	872 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	GRIK4	Q16099	956 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SHD	Q96IW2	340 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MYD88	Q99836	296 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	UFL1	O94874	794 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CES1	P23141	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MCM4	P33991	863 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	IDH3A	P50213	366 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	FCGRT	P55899	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	BRD3	Q15059	726 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	DPF2	Q92785	391 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	NACC1	Q96RE7	527 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	EYA3	Q99504	573 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	APAF1	O14727	1248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CA12	O43570	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	TRPA1	O75762	1119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ASMTL	O95671	621 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	PF4	P02776	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MYL1	P05976	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	HOXB7	P09629	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ALAS2	P22557	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	LIG3	P49916	1009 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	TNP2	Q05952	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	NOG	Q13253	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms