RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467378.1

USP11-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 696 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-205ENST00000467378 RTN1Q16799 776 aa22.15■■□□□ 1.14
USP11-205ENST00000467378 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.15■■□□□ 1.14
USP11-205ENST00000467378 RNF180Q86T96 592 aa22.15■■□□□ 1.14
USP11-205ENST00000467378 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP11-205ENST00000467378 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP11-205ENST00000467378 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.15■■□□□ 1.14
USP11-205ENST00000467378 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP11-205ENST00000467378 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP11-205ENST00000467378 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 A0A1W2PQY0 241 aa22.14■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PGK1P00558 417 aa22.14■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PPP2R5BQ15173 497 aa22.14■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 TKFCQ3LXA3 575 aa22.14■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.14■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 MAML3Q96JK9 1138 aa22.14■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.14■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.13■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 ZBTB5O15062 677 aa22.13■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 ALAS1P13196 640 aa22.13■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PBX2P40425 430 aa22.13■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 ANKRD1Q15327 319 aa22.13■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 CHST13Q8NET6 341 aa22.13■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PIGSQ96S52 555 aa22.13■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 IGFBP4P22692 258 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 FAAP100Q0VG06 881 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 FUT2Q10981 343 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PBX4Q9BYU1 374 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 RNF146Q9NTX7 359 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 FBXO40Q9UH90 709 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PNMA2Q9UL42 364 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.12■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.11■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 FBXO11Q86XK2 927 aa22.11■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 HOMER1Q86YM7 354 aa22.11■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.11■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.11■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 TIMP1P01033 207 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 FCER1AP12319 257 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 RABEP1Q15276 862 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 MMP19Q99542 508 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 AMNQ9BXJ7 453 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 ACAD9Q9H845 621 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 LCTP09848 1927 aa22.1■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 NTRK3Q16288 839 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 USH1GQ495M9 461 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 TOX2Q96NM4 488 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 ABCB11O95342 1321 aa22.08■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 STK3Q13188 491 aa22.08■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 ADGRE1Q14246 886 aa22.08■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 KCTD2Q14681 263 aa22.08■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.08■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP11-205ENST00000467378 PFKFB2O60825 505 aa22.07■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 ME3Q16798 604 aa22.07■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 TMEM240Q5SV17 173 aa22.07■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 MFSD5Q6N075 450 aa22.07■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 TINF2Q9BSI4 451 aa22.07■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 NFIBO00712 420 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 LARGE1O95461 756 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 PGK2P07205 417 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 AKR1A1P14550 325 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 ACLYP53396 1101 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 SCRN1Q12765 414 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 MSRAQ9UJ68 235 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 IFNAR1P17181 557 aa22.05■■□□□ 1.12
USP11-205ENST00000467378 TRAF1Q13077 416 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms