RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA0355O15063 1070 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 PHACTR2O75167 634 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 XYLBO75191 536 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 NEFMP07197 916 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CNGA1P29973 690 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 IRS1P35568 1242 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 RGS2P41220 211 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CACNB3P54284 484 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CTSWP56202 376 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 TLE2Q04725 743 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 MFSD14CQ5VZR4 134 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 PI16Q6UXB8 463 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS33Q8NF86 280 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFP42Q96MM3 310 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 APBA2Q99767 749 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 BRD7Q9NPI1 651 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CNTN3Q9P232 1028 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 JAG2Q9Y219 1238 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDCQ9Y266 331 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM187AA6NFU0 413 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 EREGO14944 169 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 DGAT1O75907 488 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL14Q16627 93 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 RASIP1Q5U651 963 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC191Q8NCU4 936 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 PMEPA1Q969W9 287 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP53Q96M91 514 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP63Q96MT8 703 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 MPHOSPH8Q99549 860 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 RUBCNLQ9H714 662 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 NPHS2Q9NP85 383 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 MORF4L1Q9UBU8 362 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 TSPYL4Q9UJ04 414 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 HCN2Q9UL51 889 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 MTCH2Q9Y6C9 303 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 UTYO14607 1347 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 MAST4O15021 2626 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM75PA6NK02 468 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC5A1P13866 664 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPRAP18433 802 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 MAPK4P31152 587 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 ADCYAP1R1P41586 468 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 CHRNDQ07001 517 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 LAMC2Q13753 1193 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 PKN1Q16512 942 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM240Q5SV17 173 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 TREML2Q5T2D2 321 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 OR13H1Q8NG92 308 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 TTLL11Q8NHH1 800 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 UBXN4Q92575 508 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKS1AQ92625 1134 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 TEKT1Q969V4 418 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 FERMT2Q96AC1 680 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 GSX2Q9BZM3 304 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 GREM2Q9H772 168 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 GPAMQ9HCL2 828 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-211ENST00000460558 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
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