RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 MFSD4AQ8N468 514 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF276Q8N554 614 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SLC25A41Q8N5S1 370 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 IL17DQ8TAD2 202 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 NGLY1Q96IV0 654 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 NRSN2Q9GZP1 204 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 PRDM13Q9H4Q3 707 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF358Q9NW07 568 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 HSPBP1Q9NZL4 362 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SOX13Q9UN79 622 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 PROCRQ9UNN8 238 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 APCP25054 2843 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 C5orf42Q9H799 3197 aa0.14□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 LOC400499M0QZD8 3231 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ASPMQ8IZT6 3477 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 WASH4PA8MWX3 477 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 NUDT19A8MXV4 375 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SRRM5B3KS81 715 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 IFNL4K9M1U5 179 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 BACH1O14867 736 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SEMA3EO15041 775 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 TMPRSS2O15393 492 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 B4GALT3O60512 393 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 GPR37L1O60883 481 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 TOMM70O94826 608 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 RHOBTB3O94955 611 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ACRP10323 421 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SPRR2EP22531 72 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 GJA4P35212 333 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SPRR2BP35325 72 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SPRR2AP35326 72 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 CPOXP36551 454 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SCNN1AP37088 669 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 NOVP48745 357 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 CLK3P49761 638 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 EPHA4P54764 986 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 FGD1P98174 961 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 CHRNEQ04844 493 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 TTLL4Q14679 1199 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 RAB3GAP1Q15042 981 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SLC35G1Q2M3R5 365 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 AMER3Q8N944 861 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 DBF4BQ8NFT6 615 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 DDB2Q92466 427 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 NR4A3Q92570 626 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC102AQ96A19 550 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SIRT1Q96EB6 747 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 KREMEN1Q96MU8 473 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 FANCD2OSQ96PS1 177 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 WDR18Q9BV38 432 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SYNPO2LQ9H987 977 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 C11orf16Q9NQ32 467 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 MBD2Q9UBB5 411 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 EBF1Q9UH73 591 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 FAN1Q9Y2M0 1017 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 CHMP3Q9Y3E7 222 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 LRBAP50851 2863 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.13□□□□□ -2.392e-18■■□□□ 12.6
SNORD57-201ENST00000448188 CACNA1EQ15878 2313 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 BRWD1Q9NSI6 2320 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 GLI3P10071 1580 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ATRNL1Q5VV63 1379 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 WDR91A4D1P6 747 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 NOTOA8MTQ0 251 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SMIM22K7EJ46 135 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 RNF103O00237 685 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 DIAPH2O60879 1101 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 CAMTA2O94983 1202 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 ECEL1O95672 775 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 EOMESO95936 686 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 MPOP05164 745 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD57-201ENST00000448188 SP1P08047 785 aa0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms