RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.63■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBX3O15119 743 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPM3P06753 285 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPRAP18433 802 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VCAM1P19320 739 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC15Q8TF66 581 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR2MP0CAP2 368 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BACE1P56817 501 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BLZF1Q9H2G9 400 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STK17AQ9UEE5 414 aa24.62■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF536O15090 1300 aa24.61■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC26A4O43511 780 aa24.61■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.61■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POTEMA6NI47 508 aa24.6■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPN1P04843 607 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPP2Q13103 211 aa24.6■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNB1Q14721 858 aa24.6■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LENG9Q96B70 501 aa24.6■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C12orf42Q96LP6 360 aa24.6■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNMA2Q9UL42 364 aa24.6■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RLFQ13129 1914 aa24.6■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.531e-8■□□□□ 10.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRB10Q13322 594 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT79Q5XKE5 535 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MARCH6O60337 910 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFBP00751 764 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FDX1P10109 184 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GHRHRQ02643 423 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPC24Q8NBT2 197 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNMA5Q96PV4 448 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLIN2Q99541 437 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.59■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.58■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.58■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.58■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM20AQ96MK3 541 aa24.58■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.58■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.58■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C19orf81C9J6K1 198 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM86B1E9PN63 330 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMPD3Q01432 767 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DGKZQ13574 1117 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HYIQ5T013 277 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D5Q92609 795 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MED15Q96RN5 788 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FANCLQ9NW38 375 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLRC4O43908 158 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FLOT1O75955 427 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSD17B4P51659 736 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRR16Q569H4 304 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DRC7Q8IY82 874 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM9Q9C026 710 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR90Q96KV7 1748 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF18P17022 549 aa24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FANCCQ00597 558 aa24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OTOFQ9HC10 1997 aa24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHOBTB3O94955 611 aa24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FZD1Q9UP38 647 aa24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOCS7O14512 581 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP1A3P13637 1013 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms