RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tpd52Q62393 224 aa18.96■□□□□ 0.63
Nisch-221ENSMUST00000171735 Snx13Q6PHS6 957 aa18.96■□□□□ 0.63
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tspyl4Q8VD63 406 aa18.96■□□□□ 0.63
Nisch-221ENSMUST00000171735 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Nisch-221ENSMUST00000171735 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Nisch-221ENSMUST00000171735 Clic4Q9QYB1 253 aa18.96■□□□□ 0.63
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krt28A6BLY7 462 aa18.95■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pik3r1P26450 724 aa18.95■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Madcam1Q61826 405 aa18.95■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 IqcgQ80W32 419 aa18.95■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mrpl58Q8R035 206 aa18.95■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Wfdc16A2A5H4 111 aa18.94■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zkscan7E9PVW1 718 aa18.94■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Api5O35841 504 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Wnt7aP24383 349 aa18.94■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bach1P97302 739 aa18.94■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm1587Q3UT80 123 aa18.94■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trappc3lQ4KL14 181 aa18.94■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hook1Q8BIL5 728 aa18.94■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 NenfQ9CQ45 171 aa18.94■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Erich6bQ9D4S6 220 aa18.94■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 A0A0U1RNP2 1173 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nkx1-1G3UXB3 402 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cfap157Q0VFX2 523 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hs2st1Q8R3H7 356 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rassf3Q99P51 232 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cyp26c1B2RXA7 518 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Phldb3E9QAF4 648 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Itgb5O70309 798 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trappc10Q3TLI0 1259 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zbtb7bQ64321 544 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Atg4cQ811C2 458 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mkrn1Q9QXP6 481 aa18.93■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ampd3O08739 766 aa18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nploc4P60670 608 aa18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zfp90Q61967 636 aa18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ddrgk1Q80WW9 315 aa18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Larp6Q8BN59 492 aa18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dpp9Q8BVG4 862 aa18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zcchc18Q8VD24 393 aa18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Znf687Q9D2D7 1237 aa18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 GdaQ9R111 454 aa18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 SfnO70456 248 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 LtkP08923 888 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hoxc6P10629 235 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 NfiaQ02780 532 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 PrkczQ02956 592 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nt5c2Q3V1L4 560 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kcnc4Q8R1C0 628 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Spint1Q9R097 507 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pgap3A2A559 320 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 EzrP26040 586 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krt87Q6IMF0 495 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Aoc2Q812C9 757 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ppp2r5dQ91V89 594 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hmgn5Q9JL35 406 aa18.91■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cntnap5cQ0V8T7 1305 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm4758L7N258 96 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fscn2Q32M02 492 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rusc1Q8BG26 893 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kcnv2Q8CFS6 562 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ago4Q8CJF8 861 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lrrc56Q8K375 552 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nod2Q8K3Z0 1020 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Wdr64Q9D565 1086 aa18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 SrcapA0A087WQ44 3271 aa18.89■□□□□ 0.62
Nisch-221ENSMUST00000171735 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pramel3A2AHA7 463 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm7903A2AWL1 463 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 AV320801A2AWL3 467 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cspp1B2RX88 1205 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm15023L7MUB4 467 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trdmt1O55055 415 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Adcy5P84309 1262 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Anp32cQ64G17 123 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pdcl2Q78Y63 240 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Moxd2Q7TT41 619 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Osbpl2Q8BX94 484 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lypla2Q9WTL7 231 aa18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tbc1d2B1AVH7 922 aa18.88■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 AunipE9Q6Z5 340 aa18.88■□□□□ 0.61
Nisch-221ENSMUST00000171735 Stx1aO35526 288 aa18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.1 ms