Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
Itgb5O70309 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Itgb5O70309 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Itgb5O70309 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Itgb5O70309 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Itgb5O70309 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Itgb5O70309 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Itgb5O70309 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Itgb5O70309 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Itgb5O70309 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Itgb5O70309 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Itgb5O70309 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Itgb5O70309 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Itgb5O70309 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Itgb5O70309 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Itgb5O70309 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Itgb5O70309 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Itgb5O70309 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Itgb5O70309 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Itgb5O70309 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Itgb5O70309 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Itgb5O70309 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Itgb5O70309 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Itgb5O70309 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Itgb5O70309 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Itgb5O70309 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Itgb5O70309 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Itgb5O70309 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Itgb5O70309 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Itgb5O70309 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Itgb5O70309 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Itgb5O70309 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Itgb5O70309 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Itgb5O70309 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Itgb5O70309 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Itgb5O70309 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Itgb5O70309 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Itgb5O70309 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Itgb5O70309 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Itgb5O70309 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Itgb5O70309 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Itgb5O70309 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Itgb5O70309 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Itgb5O70309 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Itgb5O70309 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Itgb5O70309 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Itgb5O70309 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Itgb5O70309 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Itgb5O70309 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Itgb5O70309 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Itgb5O70309 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Itgb5O70309 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Itgb5O70309 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Itgb5O70309 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Itgb5O70309 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Itgb5O70309 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Itgb5O70309 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Itgb5O70309 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Itgb5O70309 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Itgb5O70309 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Itgb5O70309 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Itgb5O70309 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Itgb5O70309 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Itgb5O70309 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Itgb5O70309 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Itgb5O70309 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Itgb5O70309 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Itgb5O70309 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Itgb5O70309 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Itgb5O70309 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Itgb5O70309 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Itgb5O70309 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Itgb5O70309 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Itgb5O70309 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Itgb5O70309 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Itgb5O70309 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Itgb5O70309 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Itgb5O70309 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Itgb5O70309 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Itgb5O70309 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Itgb5O70309 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Itgb5O70309 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Itgb5O70309 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Itgb5O70309 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Itgb5O70309 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Itgb5O70309 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Itgb5O70309 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Itgb5O70309 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Itgb5O70309 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Itgb5O70309 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Itgb5O70309 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Itgb5O70309 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Itgb5O70309 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Itgb5O70309 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Itgb5O70309 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Itgb5O70309 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Itgb5O70309 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Itgb5O70309 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Itgb5O70309 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Itgb5O70309 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms