Protein–RNA interactions for Protein: P60670

Nploc4, Nuclear protein localization protein 4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nploc4P60670 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
Nploc4P60670 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Nploc4P60670 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Nploc4P60670 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Nploc4P60670 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Nploc4P60670 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Nploc4P60670 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Nploc4P60670 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Nploc4P60670 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Nploc4P60670 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Nploc4P60670 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Nploc4P60670 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Nploc4P60670 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Nploc4P60670 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nploc4P60670 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Nploc4P60670 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Nploc4P60670 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nploc4P60670 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nploc4P60670 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Nploc4P60670 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Nploc4P60670 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Nploc4P60670 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Nploc4P60670 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Nploc4P60670 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Nploc4P60670 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nploc4P60670 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Nploc4P60670 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Nploc4P60670 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Nploc4P60670 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nploc4P60670 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Nploc4P60670 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Nploc4P60670 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Nploc4P60670 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Nploc4P60670 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Nploc4P60670 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Nploc4P60670 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Nploc4P60670 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Nploc4P60670 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nploc4P60670 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Nploc4P60670 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Nploc4P60670 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nploc4P60670 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Nploc4P60670 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nploc4P60670 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nploc4P60670 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Nploc4P60670 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Nploc4P60670 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Nploc4P60670 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nploc4P60670 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Nploc4P60670 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Nploc4P60670 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Nploc4P60670 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nploc4P60670 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nploc4P60670 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Nploc4P60670 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nploc4P60670 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nploc4P60670 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Nploc4P60670 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nploc4P60670 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Nploc4P60670 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nploc4P60670 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nploc4P60670 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Nploc4P60670 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nploc4P60670 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nploc4P60670 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Nploc4P60670 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nploc4P60670 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nploc4P60670 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nploc4P60670 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nploc4P60670 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nploc4P60670 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nploc4P60670 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nploc4P60670 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nploc4P60670 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nploc4P60670 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nploc4P60670 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nploc4P60670 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Nploc4P60670 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nploc4P60670 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nploc4P60670 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nploc4P60670 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nploc4P60670 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nploc4P60670 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nploc4P60670 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nploc4P60670 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nploc4P60670 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nploc4P60670 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nploc4P60670 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Nploc4P60670 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nploc4P60670 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nploc4P60670 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nploc4P60670 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nploc4P60670 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nploc4P60670 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nploc4P60670 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nploc4P60670 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nploc4P60670 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nploc4P60670 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nploc4P60670 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Nploc4P60670 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms