Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Cntnap5cQ0V8T7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Cntnap5cQ0V8T7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Cntnap5cQ0V8T7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Cntnap5cQ0V8T7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Cntnap5cQ0V8T7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Cntnap5cQ0V8T7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cntnap5cQ0V8T7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cntnap5cQ0V8T7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cntnap5cQ0V8T7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cntnap5cQ0V8T7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cntnap5cQ0V8T7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cntnap5cQ0V8T7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Cntnap5cQ0V8T7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cntnap5cQ0V8T7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cntnap5cQ0V8T7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Cntnap5cQ0V8T7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cntnap5cQ0V8T7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cntnap5cQ0V8T7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cntnap5cQ0V8T7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cntnap5cQ0V8T7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cntnap5cQ0V8T7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cntnap5cQ0V8T7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Cntnap5cQ0V8T7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cntnap5cQ0V8T7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cntnap5cQ0V8T7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cntnap5cQ0V8T7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cntnap5cQ0V8T7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cntnap5cQ0V8T7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cntnap5cQ0V8T7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cntnap5cQ0V8T7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Cntnap5cQ0V8T7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cntnap5cQ0V8T7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cntnap5cQ0V8T7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cntnap5cQ0V8T7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cntnap5cQ0V8T7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cntnap5cQ0V8T7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cntnap5cQ0V8T7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cntnap5cQ0V8T7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cntnap5cQ0V8T7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cntnap5cQ0V8T7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Cntnap5cQ0V8T7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cntnap5cQ0V8T7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cntnap5cQ0V8T7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cntnap5cQ0V8T7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cntnap5cQ0V8T7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cntnap5cQ0V8T7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cntnap5cQ0V8T7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Cntnap5cQ0V8T7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cntnap5cQ0V8T7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cntnap5cQ0V8T7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cntnap5cQ0V8T7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cntnap5cQ0V8T7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cntnap5cQ0V8T7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cntnap5cQ0V8T7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Cntnap5cQ0V8T7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cntnap5cQ0V8T7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Cntnap5cQ0V8T7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Cntnap5cQ0V8T7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Cntnap5cQ0V8T7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cntnap5cQ0V8T7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cntnap5cQ0V8T7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cntnap5cQ0V8T7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cntnap5cQ0V8T7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cntnap5cQ0V8T7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cntnap5cQ0V8T7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Cntnap5cQ0V8T7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cntnap5cQ0V8T7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cntnap5cQ0V8T7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cntnap5cQ0V8T7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms