RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 MICALL2Q8IY33 904 aa4.77□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC24A3Q9HC58 644 aa4.77□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 EMILIN3Q9NT22 766 aa4.77□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 OCEL1Q9H607 264 aa4.76□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 C2orf72A6NCS6 295 aa4.75□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 DPYSL4O14531 572 aa4.75□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 GABBR2O75899 941 aa4.75□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 BOLA1Q9Y3E2 137 aa4.75□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 PLPP6Q8IY26 295 aa4.74□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 TMC2Q8TDI7 906 aa4.74□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa4.74□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 ZMYND10O75800 440 aa4.73□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 FOXK1P85037 733 aa4.73□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.73□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.73□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SPTAN1-232ENST00000636483 POTEFA5A3E0 1075 aa4.71□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 KIF3CO14782 793 aa4.71□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 PLCG2P16885 1265 aa4.71□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 CLCN6P51797 869 aa4.71□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 NEUROD2Q15784 382 aa4.71□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM132AQ24JP5 1023 aa4.71□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 GRXCR2A6NFK2 248 aa4.7□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 G3V3G9 751 aa4.7□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 SEC24BO95487 1268 aa4.7□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 MAP3K9P80192 1104 aa4.7□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 IER5LQ5T953 404 aa4.7□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 BARGINQ6ZT62 677 aa4.7□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 DCBLD2Q96PD2 775 aa4.7□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa4.69□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 POTEIP0CG38 1075 aa4.68□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 PDIA6Q15084 440 aa4.68□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.68□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 OSBPP22059 807 aa4.66□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 DDX12PQ92771 950 aa4.66□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 AK7Q96M32 723 aa4.66□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
SPTAN1-232ENST00000636483 NUTM2FA1L443 756 aa4.65□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 POTEHQ6S545 545 aa4.65□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 OXER1Q8TDS5 423 aa4.65□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC39A7Q92504 469 aa4.65□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 EVI5O60447 810 aa4.64□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 C7P10643 843 aa4.64□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 FECHP22830 423 aa4.64□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 IL27Q8NEV9 243 aa4.64□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 METRNQ9UJH8 293 aa4.64□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM66O15016 1216 aa4.63□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR37O15354 613 aa4.63□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D12O60347 775 aa4.63□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 PTGER2P43116 358 aa4.61□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 PDE4DQ08499 809 aa4.61□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 C3orf67Q6ZVT6 689 aa4.6□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 KDM4CQ9H3R0 1056 aa4.6□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 IRF6O14896 467 aa4.59□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SPTAN1-232ENST00000636483 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 GNPATO15228 680 aa4.58□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 POTEJP0CG39 1038 aa4.58□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 C14orf37Q86TY3 774 aa4.58□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC102AQ96A19 550 aa4.58□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM117AQ9C073 453 aa4.58□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 POTEB2H3BUK9 544 aa4.57□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 FCHSD2O94868 740 aa4.57□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 CDHR5Q9HBB8 845 aa4.57□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa4.57□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC34A2O95436 690 aa4.56□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 MAP2K5Q13163 448 aa4.56□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 PTGDRQ13258 359 aa4.56□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa4.56□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 HIC1Q14526 733 aa4.55□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM161AQ3B820 660 aa4.55□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 PLEKHG3A1L390 1219 aa4.54□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 MAP3K7O43318 606 aa4.54□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 PHF14O94880 888 aa4.54□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 ARSIQ5FYB1 569 aa4.54□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 PARP9Q8IXQ6 854 aa4.54□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa4.53□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 NUDT7P0C024 238 aa4.53□□□□□ -1.68
SPTAN1-232ENST00000636483 SLAIN1Q8ND83 568 aa4.53□□□□□ -1.68
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